Protein–RNA interactions for Protein: Q04671

OCA2, P protein, humanhuman

Predictions only

Length 838 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OCA2Q04671 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
OCA2Q04671 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
OCA2Q04671 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
OCA2Q04671 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
OCA2Q04671 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
OCA2Q04671 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
OCA2Q04671 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
OCA2Q04671 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
OCA2Q04671 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
OCA2Q04671 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
OCA2Q04671 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
OCA2Q04671 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
OCA2Q04671 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
OCA2Q04671 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
OCA2Q04671 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
OCA2Q04671 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
OCA2Q04671 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
OCA2Q04671 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
OCA2Q04671 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
OCA2Q04671 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
OCA2Q04671 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
OCA2Q04671 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
OCA2Q04671 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
OCA2Q04671 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
OCA2Q04671 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
OCA2Q04671 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
OCA2Q04671 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
OCA2Q04671 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
OCA2Q04671 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
OCA2Q04671 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
OCA2Q04671 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
OCA2Q04671 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
OCA2Q04671 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
OCA2Q04671 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
OCA2Q04671 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
OCA2Q04671 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
OCA2Q04671 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
OCA2Q04671 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
OCA2Q04671 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
OCA2Q04671 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
OCA2Q04671 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
OCA2Q04671 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
OCA2Q04671 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
OCA2Q04671 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
OCA2Q04671 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
OCA2Q04671 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
OCA2Q04671 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
OCA2Q04671 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
OCA2Q04671 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
OCA2Q04671 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
OCA2Q04671 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20■□□□□ 0.79
OCA2Q04671 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
OCA2Q04671 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
OCA2Q04671 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
OCA2Q04671 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
OCA2Q04671 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
OCA2Q04671 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
OCA2Q04671 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
OCA2Q04671 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
OCA2Q04671 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
OCA2Q04671 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
OCA2Q04671 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
OCA2Q04671 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
OCA2Q04671 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
OCA2Q04671 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
OCA2Q04671 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
OCA2Q04671 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
OCA2Q04671 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
OCA2Q04671 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
OCA2Q04671 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
OCA2Q04671 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
OCA2Q04671 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
OCA2Q04671 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
OCA2Q04671 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
OCA2Q04671 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
OCA2Q04671 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
OCA2Q04671 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
OCA2Q04671 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
OCA2Q04671 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
OCA2Q04671 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
OCA2Q04671 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
OCA2Q04671 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
OCA2Q04671 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
OCA2Q04671 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
OCA2Q04671 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
OCA2Q04671 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
OCA2Q04671 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
OCA2Q04671 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
OCA2Q04671 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
OCA2Q04671 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
OCA2Q04671 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
OCA2Q04671 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
OCA2Q04671 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
OCA2Q04671 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
OCA2Q04671 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
OCA2Q04671 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
OCA2Q04671 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
OCA2Q04671 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
OCA2Q04671 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
OCA2Q04671 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms