Protein–RNA interactions for Protein: Q02928

CYP4A11, Cytochrome P450 4A11, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4A11Q02928 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CYP4A11Q02928 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CYP4A11Q02928 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CYP4A11Q02928 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CYP4A11Q02928 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CYP4A11Q02928 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CYP4A11Q02928 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CYP4A11Q02928 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CYP4A11Q02928 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CYP4A11Q02928 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CYP4A11Q02928 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CYP4A11Q02928 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CYP4A11Q02928 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CYP4A11Q02928 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CYP4A11Q02928 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CYP4A11Q02928 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CYP4A11Q02928 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CYP4A11Q02928 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CYP4A11Q02928 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CYP4A11Q02928 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CYP4A11Q02928 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CYP4A11Q02928 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CYP4A11Q02928 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CYP4A11Q02928 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CYP4A11Q02928 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CYP4A11Q02928 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CYP4A11Q02928 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CYP4A11Q02928 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CYP4A11Q02928 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CYP4A11Q02928 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CYP4A11Q02928 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CYP4A11Q02928 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CYP4A11Q02928 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CYP4A11Q02928 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CYP4A11Q02928 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CYP4A11Q02928 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CYP4A11Q02928 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CYP4A11Q02928 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CYP4A11Q02928 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CYP4A11Q02928 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CYP4A11Q02928 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CYP4A11Q02928 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CYP4A11Q02928 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CYP4A11Q02928 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CYP4A11Q02928 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CYP4A11Q02928 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CYP4A11Q02928 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CYP4A11Q02928 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CYP4A11Q02928 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CYP4A11Q02928 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CYP4A11Q02928 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CYP4A11Q02928 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CYP4A11Q02928 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CYP4A11Q02928 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CYP4A11Q02928 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CYP4A11Q02928 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CYP4A11Q02928 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CYP4A11Q02928 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CYP4A11Q02928 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CYP4A11Q02928 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CYP4A11Q02928 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CYP4A11Q02928 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CYP4A11Q02928 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CYP4A11Q02928 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CYP4A11Q02928 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CYP4A11Q02928 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CYP4A11Q02928 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CYP4A11Q02928 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CYP4A11Q02928 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CYP4A11Q02928 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CYP4A11Q02928 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CYP4A11Q02928 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CYP4A11Q02928 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CYP4A11Q02928 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CYP4A11Q02928 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CYP4A11Q02928 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CYP4A11Q02928 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CYP4A11Q02928 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CYP4A11Q02928 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CYP4A11Q02928 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CYP4A11Q02928 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CYP4A11Q02928 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CYP4A11Q02928 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CYP4A11Q02928 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CYP4A11Q02928 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CYP4A11Q02928 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CYP4A11Q02928 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CYP4A11Q02928 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CYP4A11Q02928 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CYP4A11Q02928 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CYP4A11Q02928 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CYP4A11Q02928 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CYP4A11Q02928 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CYP4A11Q02928 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CYP4A11Q02928 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CYP4A11Q02928 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CYP4A11Q02928 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CYP4A11Q02928 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CYP4A11Q02928 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CYP4A11Q02928 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms