Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NUCB1Q02818 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NUCB1Q02818 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NUCB1Q02818 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NUCB1Q02818 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
NUCB1Q02818 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NUCB1Q02818 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NUCB1Q02818 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NUCB1Q02818 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NUCB1Q02818 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NUCB1Q02818 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NUCB1Q02818 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NUCB1Q02818 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NUCB1Q02818 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NUCB1Q02818 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NUCB1Q02818 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NUCB1Q02818 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NUCB1Q02818 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NUCB1Q02818 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NUCB1Q02818 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NUCB1Q02818 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NUCB1Q02818 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NUCB1Q02818 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NUCB1Q02818 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NUCB1Q02818 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NUCB1Q02818 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NUCB1Q02818 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NUCB1Q02818 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NUCB1Q02818 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NUCB1Q02818 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NUCB1Q02818 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
NUCB1Q02818 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NUCB1Q02818 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NUCB1Q02818 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NUCB1Q02818 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NUCB1Q02818 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NUCB1Q02818 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NUCB1Q02818 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NUCB1Q02818 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NUCB1Q02818 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NUCB1Q02818 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
NUCB1Q02818 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NUCB1Q02818 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NUCB1Q02818 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NUCB1Q02818 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NUCB1Q02818 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NUCB1Q02818 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NUCB1Q02818 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NUCB1Q02818 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NUCB1Q02818 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NUCB1Q02818 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NUCB1Q02818 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NUCB1Q02818 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NUCB1Q02818 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NUCB1Q02818 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NUCB1Q02818 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NUCB1Q02818 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NUCB1Q02818 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NUCB1Q02818 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NUCB1Q02818 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NUCB1Q02818 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NUCB1Q02818 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NUCB1Q02818 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NUCB1Q02818 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NUCB1Q02818 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NUCB1Q02818 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NUCB1Q02818 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NUCB1Q02818 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NUCB1Q02818 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NUCB1Q02818 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NUCB1Q02818 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NUCB1Q02818 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NUCB1Q02818 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NUCB1Q02818 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NUCB1Q02818 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NUCB1Q02818 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NUCB1Q02818 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
NUCB1Q02818 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NUCB1Q02818 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NUCB1Q02818 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NUCB1Q02818 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NUCB1Q02818 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NUCB1Q02818 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NUCB1Q02818 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NUCB1Q02818 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NUCB1Q02818 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NUCB1Q02818 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NUCB1Q02818 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NUCB1Q02818 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NUCB1Q02818 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NUCB1Q02818 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NUCB1Q02818 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NUCB1Q02818 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NUCB1Q02818 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NUCB1Q02818 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NUCB1Q02818 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NUCB1Q02818 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NUCB1Q02818 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NUCB1Q02818 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NUCB1Q02818 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms