Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DSG1Q02413 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DSG1Q02413 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DSG1Q02413 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DSG1Q02413 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DSG1Q02413 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DSG1Q02413 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DSG1Q02413 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DSG1Q02413 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DSG1Q02413 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DSG1Q02413 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DSG1Q02413 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DSG1Q02413 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DSG1Q02413 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DSG1Q02413 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DSG1Q02413 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DSG1Q02413 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DSG1Q02413 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DSG1Q02413 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
DSG1Q02413 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
DSG1Q02413 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DSG1Q02413 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
DSG1Q02413 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DSG1Q02413 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DSG1Q02413 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DSG1Q02413 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DSG1Q02413 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DSG1Q02413 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DSG1Q02413 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DSG1Q02413 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DSG1Q02413 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DSG1Q02413 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DSG1Q02413 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DSG1Q02413 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
DSG1Q02413 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DSG1Q02413 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DSG1Q02413 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DSG1Q02413 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DSG1Q02413 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DSG1Q02413 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DSG1Q02413 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DSG1Q02413 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DSG1Q02413 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DSG1Q02413 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DSG1Q02413 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DSG1Q02413 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
DSG1Q02413 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
DSG1Q02413 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DSG1Q02413 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DSG1Q02413 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DSG1Q02413 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DSG1Q02413 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DSG1Q02413 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DSG1Q02413 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DSG1Q02413 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DSG1Q02413 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DSG1Q02413 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DSG1Q02413 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DSG1Q02413 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DSG1Q02413 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DSG1Q02413 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DSG1Q02413 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DSG1Q02413 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DSG1Q02413 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DSG1Q02413 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DSG1Q02413 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DSG1Q02413 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
DSG1Q02413 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DSG1Q02413 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DSG1Q02413 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DSG1Q02413 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DSG1Q02413 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DSG1Q02413 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DSG1Q02413 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DSG1Q02413 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
DSG1Q02413 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DSG1Q02413 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DSG1Q02413 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DSG1Q02413 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
DSG1Q02413 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DSG1Q02413 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DSG1Q02413 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DSG1Q02413 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DSG1Q02413 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DSG1Q02413 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DSG1Q02413 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DSG1Q02413 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DSG1Q02413 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DSG1Q02413 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DSG1Q02413 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DSG1Q02413 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DSG1Q02413 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
DSG1Q02413 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DSG1Q02413 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DSG1Q02413 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DSG1Q02413 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DSG1Q02413 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DSG1Q02413 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DSG1Q02413 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DSG1Q02413 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms