Protein–RNA interactions for Protein: Q01459

CTBS, Di-N-acetylchitobiase, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBSQ01459 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTBSQ01459 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTBSQ01459 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTBSQ01459 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTBSQ01459 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTBSQ01459 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTBSQ01459 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTBSQ01459 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTBSQ01459 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CTBSQ01459 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTBSQ01459 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTBSQ01459 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTBSQ01459 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTBSQ01459 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTBSQ01459 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTBSQ01459 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTBSQ01459 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTBSQ01459 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTBSQ01459 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTBSQ01459 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTBSQ01459 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTBSQ01459 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTBSQ01459 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTBSQ01459 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTBSQ01459 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTBSQ01459 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CTBSQ01459 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTBSQ01459 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CTBSQ01459 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CTBSQ01459 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CTBSQ01459 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTBSQ01459 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTBSQ01459 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTBSQ01459 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTBSQ01459 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTBSQ01459 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTBSQ01459 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTBSQ01459 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTBSQ01459 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTBSQ01459 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTBSQ01459 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTBSQ01459 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTBSQ01459 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTBSQ01459 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTBSQ01459 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTBSQ01459 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CTBSQ01459 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTBSQ01459 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTBSQ01459 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTBSQ01459 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTBSQ01459 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTBSQ01459 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTBSQ01459 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTBSQ01459 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTBSQ01459 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTBSQ01459 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTBSQ01459 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTBSQ01459 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTBSQ01459 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTBSQ01459 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTBSQ01459 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTBSQ01459 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTBSQ01459 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTBSQ01459 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTBSQ01459 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CTBSQ01459 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTBSQ01459 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTBSQ01459 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTBSQ01459 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CTBSQ01459 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTBSQ01459 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTBSQ01459 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTBSQ01459 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTBSQ01459 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTBSQ01459 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTBSQ01459 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTBSQ01459 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTBSQ01459 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTBSQ01459 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTBSQ01459 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CTBSQ01459 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CTBSQ01459 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTBSQ01459 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTBSQ01459 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CTBSQ01459 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTBSQ01459 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTBSQ01459 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTBSQ01459 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTBSQ01459 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTBSQ01459 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTBSQ01459 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTBSQ01459 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTBSQ01459 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTBSQ01459 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTBSQ01459 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTBSQ01459 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTBSQ01459 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTBSQ01459 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTBSQ01459 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTBSQ01459 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms