Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT1

PRCD, Progressive rod-cone degeneration protein, humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRCDQ00LT1 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PRCDQ00LT1 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PRCDQ00LT1 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRCDQ00LT1 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRCDQ00LT1 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRCDQ00LT1 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRCDQ00LT1 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRCDQ00LT1 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRCDQ00LT1 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRCDQ00LT1 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRCDQ00LT1 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRCDQ00LT1 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRCDQ00LT1 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRCDQ00LT1 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRCDQ00LT1 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRCDQ00LT1 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRCDQ00LT1 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRCDQ00LT1 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRCDQ00LT1 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRCDQ00LT1 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRCDQ00LT1 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRCDQ00LT1 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRCDQ00LT1 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRCDQ00LT1 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRCDQ00LT1 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PRCDQ00LT1 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PRCDQ00LT1 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRCDQ00LT1 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRCDQ00LT1 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRCDQ00LT1 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRCDQ00LT1 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRCDQ00LT1 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRCDQ00LT1 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRCDQ00LT1 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRCDQ00LT1 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRCDQ00LT1 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRCDQ00LT1 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRCDQ00LT1 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRCDQ00LT1 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRCDQ00LT1 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRCDQ00LT1 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRCDQ00LT1 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRCDQ00LT1 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRCDQ00LT1 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRCDQ00LT1 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRCDQ00LT1 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRCDQ00LT1 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRCDQ00LT1 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRCDQ00LT1 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRCDQ00LT1 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PRCDQ00LT1 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRCDQ00LT1 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRCDQ00LT1 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PRCDQ00LT1 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRCDQ00LT1 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRCDQ00LT1 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRCDQ00LT1 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRCDQ00LT1 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRCDQ00LT1 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRCDQ00LT1 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRCDQ00LT1 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRCDQ00LT1 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRCDQ00LT1 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRCDQ00LT1 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRCDQ00LT1 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRCDQ00LT1 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRCDQ00LT1 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRCDQ00LT1 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRCDQ00LT1 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRCDQ00LT1 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRCDQ00LT1 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRCDQ00LT1 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRCDQ00LT1 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRCDQ00LT1 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRCDQ00LT1 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRCDQ00LT1 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRCDQ00LT1 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRCDQ00LT1 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRCDQ00LT1 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRCDQ00LT1 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRCDQ00LT1 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRCDQ00LT1 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRCDQ00LT1 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PRCDQ00LT1 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PRCDQ00LT1 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PRCDQ00LT1 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRCDQ00LT1 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRCDQ00LT1 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRCDQ00LT1 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRCDQ00LT1 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRCDQ00LT1 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRCDQ00LT1 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRCDQ00LT1 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRCDQ00LT1 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRCDQ00LT1 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PRCDQ00LT1 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRCDQ00LT1 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PRCDQ00LT1 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRCDQ00LT1 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRCDQ00LT1 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms