Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2BQ00403 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF2BQ00403 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF2BQ00403 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF2BQ00403 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF2BQ00403 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF2BQ00403 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF2BQ00403 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF2BQ00403 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF2BQ00403 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF2BQ00403 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF2BQ00403 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF2BQ00403 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF2BQ00403 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF2BQ00403 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF2BQ00403 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF2BQ00403 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF2BQ00403 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF2BQ00403 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF2BQ00403 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF2BQ00403 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF2BQ00403 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF2BQ00403 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF2BQ00403 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF2BQ00403 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF2BQ00403 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF2BQ00403 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF2BQ00403 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GTF2BQ00403 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GTF2BQ00403 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GTF2BQ00403 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GTF2BQ00403 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF2BQ00403 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF2BQ00403 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF2BQ00403 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF2BQ00403 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF2BQ00403 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF2BQ00403 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF2BQ00403 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF2BQ00403 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF2BQ00403 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF2BQ00403 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF2BQ00403 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF2BQ00403 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF2BQ00403 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF2BQ00403 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF2BQ00403 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF2BQ00403 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF2BQ00403 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF2BQ00403 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF2BQ00403 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF2BQ00403 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF2BQ00403 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF2BQ00403 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF2BQ00403 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF2BQ00403 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF2BQ00403 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF2BQ00403 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF2BQ00403 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF2BQ00403 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF2BQ00403 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF2BQ00403 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF2BQ00403 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF2BQ00403 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF2BQ00403 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF2BQ00403 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF2BQ00403 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF2BQ00403 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF2BQ00403 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF2BQ00403 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF2BQ00403 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF2BQ00403 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GTF2BQ00403 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF2BQ00403 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF2BQ00403 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF2BQ00403 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF2BQ00403 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF2BQ00403 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF2BQ00403 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF2BQ00403 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF2BQ00403 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF2BQ00403 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF2BQ00403 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF2BQ00403 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF2BQ00403 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF2BQ00403 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF2BQ00403 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GTF2BQ00403 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF2BQ00403 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF2BQ00403 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF2BQ00403 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF2BQ00403 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF2BQ00403 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF2BQ00403 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF2BQ00403 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF2BQ00403 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF2BQ00403 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF2BQ00403 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF2BQ00403 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF2BQ00403 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms