Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TFAMQ00059 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TFAMQ00059 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TFAMQ00059 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TFAMQ00059 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TFAMQ00059 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TFAMQ00059 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TFAMQ00059 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TFAMQ00059 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TFAMQ00059 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TFAMQ00059 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TFAMQ00059 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TFAMQ00059 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TFAMQ00059 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TFAMQ00059 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TFAMQ00059 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TFAMQ00059 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TFAMQ00059 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TFAMQ00059 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TFAMQ00059 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TFAMQ00059 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TFAMQ00059 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TFAMQ00059 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TFAMQ00059 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TFAMQ00059 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TFAMQ00059 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TFAMQ00059 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TFAMQ00059 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TFAMQ00059 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TFAMQ00059 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TFAMQ00059 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TFAMQ00059 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TFAMQ00059 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TFAMQ00059 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TFAMQ00059 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TFAMQ00059 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TFAMQ00059 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TFAMQ00059 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TFAMQ00059 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TFAMQ00059 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TFAMQ00059 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TFAMQ00059 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TFAMQ00059 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TFAMQ00059 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TFAMQ00059 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TFAMQ00059 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TFAMQ00059 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TFAMQ00059 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TFAMQ00059 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TFAMQ00059 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TFAMQ00059 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TFAMQ00059 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TFAMQ00059 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TFAMQ00059 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TFAMQ00059 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TFAMQ00059 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TFAMQ00059 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TFAMQ00059 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TFAMQ00059 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TFAMQ00059 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TFAMQ00059 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TFAMQ00059 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TFAMQ00059 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TFAMQ00059 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TFAMQ00059 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TFAMQ00059 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TFAMQ00059 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TFAMQ00059 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TFAMQ00059 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TFAMQ00059 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TFAMQ00059 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TFAMQ00059 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TFAMQ00059 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TFAMQ00059 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TFAMQ00059 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TFAMQ00059 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TFAMQ00059 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TFAMQ00059 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TFAMQ00059 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TFAMQ00059 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TFAMQ00059 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TFAMQ00059 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TFAMQ00059 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TFAMQ00059 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TFAMQ00059 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TFAMQ00059 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TFAMQ00059 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TFAMQ00059 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TFAMQ00059 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TFAMQ00059 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TFAMQ00059 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TFAMQ00059 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TFAMQ00059 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TFAMQ00059 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TFAMQ00059 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TFAMQ00059 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TFAMQ00059 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TFAMQ00059 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TFAMQ00059 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TFAMQ00059 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms