Protein–RNA interactions for Protein: P98161

PKD1, Polycystin-1, humanhuman

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Length 4,303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD1P98161 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PKD1P98161 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PKD1P98161 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PKD1P98161 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PKD1P98161 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PKD1P98161 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PKD1P98161 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PKD1P98161 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PKD1P98161 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PKD1P98161 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PKD1P98161 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PKD1P98161 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PKD1P98161 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PKD1P98161 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PKD1P98161 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PKD1P98161 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PKD1P98161 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PKD1P98161 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PKD1P98161 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PKD1P98161 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PKD1P98161 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PKD1P98161 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PKD1P98161 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PKD1P98161 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PKD1P98161 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PKD1P98161 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PKD1P98161 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PKD1P98161 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PKD1P98161 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PKD1P98161 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PKD1P98161 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PKD1P98161 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PKD1P98161 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PKD1P98161 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PKD1P98161 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PKD1P98161 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PKD1P98161 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PKD1P98161 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PKD1P98161 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PKD1P98161 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PKD1P98161 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PKD1P98161 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PKD1P98161 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PKD1P98161 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PKD1P98161 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PKD1P98161 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PKD1P98161 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PKD1P98161 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PKD1P98161 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PKD1P98161 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PKD1P98161 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PKD1P98161 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PKD1P98161 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PKD1P98161 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PKD1P98161 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PKD1P98161 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PKD1P98161 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PKD1P98161 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PKD1P98161 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PKD1P98161 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PKD1P98161 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PKD1P98161 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PKD1P98161 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PKD1P98161 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PKD1P98161 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PKD1P98161 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PKD1P98161 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PKD1P98161 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PKD1P98161 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PKD1P98161 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PKD1P98161 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PKD1P98161 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PKD1P98161 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PKD1P98161 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PKD1P98161 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PKD1P98161 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PKD1P98161 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PKD1P98161 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PKD1P98161 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PKD1P98161 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PKD1P98161 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PKD1P98161 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PKD1P98161 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PKD1P98161 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PKD1P98161 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PKD1P98161 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PKD1P98161 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PKD1P98161 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PKD1P98161 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PKD1P98161 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PKD1P98161 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PKD1P98161 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PKD1P98161 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PKD1P98161 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PKD1P98161 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PKD1P98161 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PKD1P98161 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PKD1P98161 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PKD1P98161 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PKD1P98161 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
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