Protein–RNA interactions for Protein: P81877

SSBP2, Single-stranded DNA-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP2P81877 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SSBP2P81877 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSBP2P81877 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSBP2P81877 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSBP2P81877 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSBP2P81877 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSBP2P81877 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSBP2P81877 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSBP2P81877 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSBP2P81877 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SSBP2P81877 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSBP2P81877 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSBP2P81877 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSBP2P81877 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSBP2P81877 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSBP2P81877 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSBP2P81877 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSBP2P81877 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSBP2P81877 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSBP2P81877 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSBP2P81877 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSBP2P81877 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSBP2P81877 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSBP2P81877 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSBP2P81877 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSBP2P81877 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSBP2P81877 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSBP2P81877 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSBP2P81877 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SSBP2P81877 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SSBP2P81877 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SSBP2P81877 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SSBP2P81877 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SSBP2P81877 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SSBP2P81877 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SSBP2P81877 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SSBP2P81877 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSBP2P81877 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSBP2P81877 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSBP2P81877 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSBP2P81877 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSBP2P81877 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSBP2P81877 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSBP2P81877 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSBP2P81877 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SSBP2P81877 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSBP2P81877 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSBP2P81877 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSBP2P81877 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SSBP2P81877 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSBP2P81877 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSBP2P81877 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSBP2P81877 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SSBP2P81877 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSBP2P81877 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSBP2P81877 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSBP2P81877 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSBP2P81877 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSBP2P81877 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSBP2P81877 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSBP2P81877 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSBP2P81877 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSBP2P81877 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSBP2P81877 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSBP2P81877 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSBP2P81877 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSBP2P81877 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSBP2P81877 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSBP2P81877 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSBP2P81877 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSBP2P81877 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSBP2P81877 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSBP2P81877 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSBP2P81877 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSBP2P81877 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSBP2P81877 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSBP2P81877 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSBP2P81877 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSBP2P81877 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSBP2P81877 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSBP2P81877 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSBP2P81877 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSBP2P81877 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSBP2P81877 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SSBP2P81877 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSBP2P81877 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSBP2P81877 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSBP2P81877 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SSBP2P81877 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SSBP2P81877 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SSBP2P81877 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SSBP2P81877 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SSBP2P81877 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SSBP2P81877 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SSBP2P81877 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SSBP2P81877 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SSBP2P81877 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SSBP2P81877 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SSBP2P81877 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SSBP2P81877 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms