Protein–RNA interactions for Protein: P78369

CLDN10, Claudin-10, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN10P78369 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLDN10P78369 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLDN10P78369 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLDN10P78369 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLDN10P78369 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLDN10P78369 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLDN10P78369 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLDN10P78369 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLDN10P78369 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLDN10P78369 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CLDN10P78369 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLDN10P78369 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLDN10P78369 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLDN10P78369 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLDN10P78369 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLDN10P78369 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLDN10P78369 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLDN10P78369 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLDN10P78369 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLDN10P78369 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLDN10P78369 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLDN10P78369 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLDN10P78369 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLDN10P78369 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLDN10P78369 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLDN10P78369 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLDN10P78369 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLDN10P78369 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLDN10P78369 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLDN10P78369 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLDN10P78369 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLDN10P78369 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CLDN10P78369 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLDN10P78369 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLDN10P78369 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLDN10P78369 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLDN10P78369 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLDN10P78369 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLDN10P78369 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLDN10P78369 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLDN10P78369 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLDN10P78369 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLDN10P78369 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLDN10P78369 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLDN10P78369 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLDN10P78369 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLDN10P78369 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLDN10P78369 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLDN10P78369 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLDN10P78369 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLDN10P78369 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CLDN10P78369 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLDN10P78369 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLDN10P78369 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLDN10P78369 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLDN10P78369 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLDN10P78369 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLDN10P78369 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLDN10P78369 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CLDN10P78369 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLDN10P78369 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLDN10P78369 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLDN10P78369 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLDN10P78369 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLDN10P78369 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLDN10P78369 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLDN10P78369 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLDN10P78369 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLDN10P78369 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLDN10P78369 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLDN10P78369 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLDN10P78369 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLDN10P78369 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CLDN10P78369 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLDN10P78369 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLDN10P78369 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLDN10P78369 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CLDN10P78369 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CLDN10P78369 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLDN10P78369 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLDN10P78369 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLDN10P78369 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLDN10P78369 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLDN10P78369 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLDN10P78369 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLDN10P78369 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLDN10P78369 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLDN10P78369 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLDN10P78369 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLDN10P78369 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLDN10P78369 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLDN10P78369 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLDN10P78369 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLDN10P78369 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CLDN10P78369 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CLDN10P78369 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CLDN10P78369 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLDN10P78369 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLDN10P78369 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLDN10P78369 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms