Protein–RNA interactions for Protein: P78337

PITX1, Pituitary homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1P78337 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PITX1P78337 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PITX1P78337 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PITX1P78337 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PITX1P78337 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PITX1P78337 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PITX1P78337 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PITX1P78337 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PITX1P78337 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PITX1P78337 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PITX1P78337 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PITX1P78337 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PITX1P78337 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PITX1P78337 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PITX1P78337 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PITX1P78337 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PITX1P78337 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PITX1P78337 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PITX1P78337 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PITX1P78337 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PITX1P78337 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PITX1P78337 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PITX1P78337 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PITX1P78337 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PITX1P78337 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PITX1P78337 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PITX1P78337 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PITX1P78337 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PITX1P78337 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PITX1P78337 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PITX1P78337 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PITX1P78337 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PITX1P78337 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PITX1P78337 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PITX1P78337 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PITX1P78337 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PITX1P78337 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PITX1P78337 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PITX1P78337 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PITX1P78337 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PITX1P78337 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PITX1P78337 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PITX1P78337 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PITX1P78337 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PITX1P78337 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PITX1P78337 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PITX1P78337 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PITX1P78337 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PITX1P78337 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PITX1P78337 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PITX1P78337 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PITX1P78337 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PITX1P78337 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PITX1P78337 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PITX1P78337 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PITX1P78337 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PITX1P78337 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PITX1P78337 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PITX1P78337 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PITX1P78337 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PITX1P78337 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PITX1P78337 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PITX1P78337 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PITX1P78337 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PITX1P78337 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PITX1P78337 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PITX1P78337 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PITX1P78337 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PITX1P78337 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PITX1P78337 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PITX1P78337 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PITX1P78337 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PITX1P78337 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PITX1P78337 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PITX1P78337 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PITX1P78337 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PITX1P78337 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PITX1P78337 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PITX1P78337 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PITX1P78337 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PITX1P78337 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PITX1P78337 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PITX1P78337 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PITX1P78337 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PITX1P78337 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PITX1P78337 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PITX1P78337 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PITX1P78337 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PITX1P78337 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PITX1P78337 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PITX1P78337 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PITX1P78337 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PITX1P78337 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PITX1P78337 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PITX1P78337 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PITX1P78337 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PITX1P78337 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PITX1P78337 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PITX1P78337 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PITX1P78337 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms