Protein–RNA interactions for Protein: P62851

RPS25, 40S ribosomal protein S25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS25P62851 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPS25P62851 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPS25P62851 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPS25P62851 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPS25P62851 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPS25P62851 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPS25P62851 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPS25P62851 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPS25P62851 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPS25P62851 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPS25P62851 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPS25P62851 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPS25P62851 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPS25P62851 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPS25P62851 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPS25P62851 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPS25P62851 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPS25P62851 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPS25P62851 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPS25P62851 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPS25P62851 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPS25P62851 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RPS25P62851 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPS25P62851 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPS25P62851 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPS25P62851 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPS25P62851 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPS25P62851 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPS25P62851 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPS25P62851 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPS25P62851 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPS25P62851 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPS25P62851 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPS25P62851 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPS25P62851 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPS25P62851 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPS25P62851 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPS25P62851 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPS25P62851 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPS25P62851 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPS25P62851 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPS25P62851 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPS25P62851 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPS25P62851 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPS25P62851 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPS25P62851 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPS25P62851 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPS25P62851 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPS25P62851 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPS25P62851 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
RPS25P62851 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPS25P62851 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPS25P62851 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPS25P62851 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPS25P62851 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPS25P62851 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPS25P62851 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPS25P62851 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPS25P62851 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPS25P62851 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPS25P62851 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RPS25P62851 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RPS25P62851 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RPS25P62851 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RPS25P62851 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RPS25P62851 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RPS25P62851 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RPS25P62851 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RPS25P62851 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPS25P62851 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPS25P62851 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPS25P62851 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPS25P62851 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPS25P62851 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPS25P62851 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPS25P62851 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPS25P62851 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPS25P62851 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPS25P62851 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPS25P62851 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPS25P62851 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPS25P62851 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPS25P62851 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPS25P62851 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPS25P62851 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPS25P62851 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPS25P62851 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPS25P62851 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPS25P62851 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPS25P62851 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPS25P62851 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPS25P62851 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPS25P62851 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPS25P62851 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPS25P62851 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPS25P62851 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPS25P62851 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPS25P62851 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPS25P62851 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPS25P62851 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms