Protein–RNA interactions for Protein: P62829

RPL23, 60S ribosomal protein L23, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23P62829 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL23P62829 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL23P62829 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL23P62829 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPL23P62829 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RPL23P62829 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPL23P62829 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPL23P62829 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPL23P62829 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPL23P62829 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPL23P62829 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPL23P62829 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPL23P62829 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPL23P62829 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPL23P62829 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPL23P62829 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPL23P62829 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPL23P62829 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPL23P62829 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPL23P62829 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPL23P62829 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RPL23P62829 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPL23P62829 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPL23P62829 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPL23P62829 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL23P62829 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL23P62829 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL23P62829 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL23P62829 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL23P62829 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL23P62829 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL23P62829 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL23P62829 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL23P62829 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL23P62829 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL23P62829 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL23P62829 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL23P62829 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL23P62829 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL23P62829 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL23P62829 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL23P62829 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL23P62829 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL23P62829 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL23P62829 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL23P62829 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL23P62829 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL23P62829 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL23P62829 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL23P62829 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL23P62829 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL23P62829 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL23P62829 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL23P62829 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL23P62829 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL23P62829 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL23P62829 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL23P62829 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL23P62829 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL23P62829 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL23P62829 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL23P62829 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL23P62829 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL23P62829 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL23P62829 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL23P62829 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL23P62829 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL23P62829 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL23P62829 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL23P62829 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL23P62829 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL23P62829 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL23P62829 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL23P62829 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL23P62829 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL23P62829 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL23P62829 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL23P62829 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL23P62829 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL23P62829 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL23P62829 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL23P62829 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL23P62829 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL23P62829 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL23P62829 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL23P62829 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL23P62829 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL23P62829 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL23P62829 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL23P62829 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL23P62829 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL23P62829 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL23P62829 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL23P62829 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL23P62829 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL23P62829 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPL23P62829 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPL23P62829 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPL23P62829 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPL23P62829 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms