Protein–RNA interactions for Protein: P61218

POLR2F, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2FP61218 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR2FP61218 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR2FP61218 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR2FP61218 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR2FP61218 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR2FP61218 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR2FP61218 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR2FP61218 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR2FP61218 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR2FP61218 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR2FP61218 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR2FP61218 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR2FP61218 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR2FP61218 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR2FP61218 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR2FP61218 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR2FP61218 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR2FP61218 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR2FP61218 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR2FP61218 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR2FP61218 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR2FP61218 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR2FP61218 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR2FP61218 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR2FP61218 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR2FP61218 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR2FP61218 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR2FP61218 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR2FP61218 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR2FP61218 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR2FP61218 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR2FP61218 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR2FP61218 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR2FP61218 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR2FP61218 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR2FP61218 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR2FP61218 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR2FP61218 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR2FP61218 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR2FP61218 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR2FP61218 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR2FP61218 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR2FP61218 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR2FP61218 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR2FP61218 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR2FP61218 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR2FP61218 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLR2FP61218 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR2FP61218 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR2FP61218 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR2FP61218 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR2FP61218 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR2FP61218 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR2FP61218 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR2FP61218 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR2FP61218 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR2FP61218 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR2FP61218 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR2FP61218 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLR2FP61218 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
POLR2FP61218 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
POLR2FP61218 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
POLR2FP61218 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
POLR2FP61218 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
POLR2FP61218 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR2FP61218 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR2FP61218 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR2FP61218 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR2FP61218 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR2FP61218 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR2FP61218 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR2FP61218 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR2FP61218 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
POLR2FP61218 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR2FP61218 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR2FP61218 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR2FP61218 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR2FP61218 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR2FP61218 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR2FP61218 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR2FP61218 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR2FP61218 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR2FP61218 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR2FP61218 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR2FP61218 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR2FP61218 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR2FP61218 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR2FP61218 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR2FP61218 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR2FP61218 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR2FP61218 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR2FP61218 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR2FP61218 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR2FP61218 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR2FP61218 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR2FP61218 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR2FP61218 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR2FP61218 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR2FP61218 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR2FP61218 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms