Protein–RNA interactions for Protein: P60412

KRTAP10-11, Keratin-associated protein 10-11, humanhuman

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP10-11P60412 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRTAP10-11P60412 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRTAP10-11P60412 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRTAP10-11P60412 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRTAP10-11P60412 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRTAP10-11P60412 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRTAP10-11P60412 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRTAP10-11P60412 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KRTAP10-11P60412 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KRTAP10-11P60412 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRTAP10-11P60412 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRTAP10-11P60412 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRTAP10-11P60412 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRTAP10-11P60412 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KRTAP10-11P60412 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRTAP10-11P60412 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRTAP10-11P60412 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRTAP10-11P60412 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRTAP10-11P60412 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRTAP10-11P60412 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRTAP10-11P60412 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRTAP10-11P60412 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRTAP10-11P60412 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRTAP10-11P60412 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRTAP10-11P60412 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRTAP10-11P60412 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KRTAP10-11P60412 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRTAP10-11P60412 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRTAP10-11P60412 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRTAP10-11P60412 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRTAP10-11P60412 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRTAP10-11P60412 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRTAP10-11P60412 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRTAP10-11P60412 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRTAP10-11P60412 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRTAP10-11P60412 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRTAP10-11P60412 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRTAP10-11P60412 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRTAP10-11P60412 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRTAP10-11P60412 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRTAP10-11P60412 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRTAP10-11P60412 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRTAP10-11P60412 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRTAP10-11P60412 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRTAP10-11P60412 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRTAP10-11P60412 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRTAP10-11P60412 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRTAP10-11P60412 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRTAP10-11P60412 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRTAP10-11P60412 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRTAP10-11P60412 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KRTAP10-11P60412 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRTAP10-11P60412 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRTAP10-11P60412 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRTAP10-11P60412 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRTAP10-11P60412 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KRTAP10-11P60412 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRTAP10-11P60412 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRTAP10-11P60412 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRTAP10-11P60412 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRTAP10-11P60412 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRTAP10-11P60412 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRTAP10-11P60412 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRTAP10-11P60412 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRTAP10-11P60412 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRTAP10-11P60412 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRTAP10-11P60412 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRTAP10-11P60412 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRTAP10-11P60412 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRTAP10-11P60412 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRTAP10-11P60412 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
KRTAP10-11P60412 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRTAP10-11P60412 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRTAP10-11P60412 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRTAP10-11P60412 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRTAP10-11P60412 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRTAP10-11P60412 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRTAP10-11P60412 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRTAP10-11P60412 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRTAP10-11P60412 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
KRTAP10-11P60412 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRTAP10-11P60412 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRTAP10-11P60412 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRTAP10-11P60412 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRTAP10-11P60412 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRTAP10-11P60412 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRTAP10-11P60412 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRTAP10-11P60412 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRTAP10-11P60412 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRTAP10-11P60412 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRTAP10-11P60412 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRTAP10-11P60412 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRTAP10-11P60412 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRTAP10-11P60412 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRTAP10-11P60412 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRTAP10-11P60412 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRTAP10-11P60412 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRTAP10-11P60412 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRTAP10-11P60412 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRTAP10-11P60412 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms