Protein–RNA interactions for Protein: P57796

CABP4, Calcium-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP4P57796 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CABP4P57796 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CABP4P57796 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CABP4P57796 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CABP4P57796 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CABP4P57796 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CABP4P57796 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CABP4P57796 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CABP4P57796 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CABP4P57796 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CABP4P57796 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CABP4P57796 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CABP4P57796 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CABP4P57796 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CABP4P57796 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CABP4P57796 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CABP4P57796 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CABP4P57796 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CABP4P57796 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CABP4P57796 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CABP4P57796 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CABP4P57796 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CABP4P57796 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CABP4P57796 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CABP4P57796 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CABP4P57796 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CABP4P57796 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CABP4P57796 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CABP4P57796 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CABP4P57796 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CABP4P57796 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CABP4P57796 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CABP4P57796 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
CABP4P57796 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
CABP4P57796 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
CABP4P57796 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CABP4P57796 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CABP4P57796 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CABP4P57796 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CABP4P57796 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CABP4P57796 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CABP4P57796 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CABP4P57796 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CABP4P57796 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CABP4P57796 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CABP4P57796 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CABP4P57796 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CABP4P57796 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CABP4P57796 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CABP4P57796 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CABP4P57796 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CABP4P57796 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CABP4P57796 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CABP4P57796 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CABP4P57796 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CABP4P57796 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CABP4P57796 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CABP4P57796 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CABP4P57796 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CABP4P57796 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CABP4P57796 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CABP4P57796 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CABP4P57796 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CABP4P57796 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CABP4P57796 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CABP4P57796 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CABP4P57796 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CABP4P57796 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CABP4P57796 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CABP4P57796 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CABP4P57796 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CABP4P57796 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CABP4P57796 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CABP4P57796 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CABP4P57796 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CABP4P57796 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CABP4P57796 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CABP4P57796 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CABP4P57796 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CABP4P57796 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CABP4P57796 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CABP4P57796 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CABP4P57796 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CABP4P57796 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CABP4P57796 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CABP4P57796 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CABP4P57796 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CABP4P57796 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CABP4P57796 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CABP4P57796 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CABP4P57796 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CABP4P57796 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CABP4P57796 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CABP4P57796 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CABP4P57796 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CABP4P57796 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CABP4P57796 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CABP4P57796 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CABP4P57796 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CABP4P57796 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms