Protein–RNA interactions for Protein: P57772

EEFSEC, Selenocysteine-specific elongation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEFSECP57772 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
EEFSECP57772 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
EEFSECP57772 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
EEFSECP57772 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
EEFSECP57772 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
EEFSECP57772 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
EEFSECP57772 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
EEFSECP57772 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
EEFSECP57772 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
EEFSECP57772 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
EEFSECP57772 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
EEFSECP57772 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
EEFSECP57772 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
EEFSECP57772 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
EEFSECP57772 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
EEFSECP57772 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
EEFSECP57772 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
EEFSECP57772 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
EEFSECP57772 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
EEFSECP57772 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
EEFSECP57772 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
EEFSECP57772 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
EEFSECP57772 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
EEFSECP57772 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
EEFSECP57772 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
EEFSECP57772 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
EEFSECP57772 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
EEFSECP57772 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
EEFSECP57772 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
EEFSECP57772 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
EEFSECP57772 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
EEFSECP57772 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
EEFSECP57772 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
EEFSECP57772 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
EEFSECP57772 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
EEFSECP57772 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
EEFSECP57772 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
EEFSECP57772 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
EEFSECP57772 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
EEFSECP57772 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
EEFSECP57772 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
EEFSECP57772 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
EEFSECP57772 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
EEFSECP57772 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
EEFSECP57772 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
EEFSECP57772 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
EEFSECP57772 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
EEFSECP57772 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
EEFSECP57772 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
EEFSECP57772 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
EEFSECP57772 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
EEFSECP57772 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
EEFSECP57772 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
EEFSECP57772 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
EEFSECP57772 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
EEFSECP57772 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
EEFSECP57772 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
EEFSECP57772 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
EEFSECP57772 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
EEFSECP57772 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
EEFSECP57772 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
EEFSECP57772 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
EEFSECP57772 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
EEFSECP57772 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
EEFSECP57772 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
EEFSECP57772 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
EEFSECP57772 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
EEFSECP57772 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
EEFSECP57772 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
EEFSECP57772 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
EEFSECP57772 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
EEFSECP57772 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
EEFSECP57772 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
EEFSECP57772 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
EEFSECP57772 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
EEFSECP57772 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
EEFSECP57772 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
EEFSECP57772 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
EEFSECP57772 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
EEFSECP57772 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
EEFSECP57772 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC19.65■□□□□ 0.74
EEFSECP57772 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
EEFSECP57772 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
EEFSECP57772 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
EEFSECP57772 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
EEFSECP57772 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
EEFSECP57772 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
EEFSECP57772 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
EEFSECP57772 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
EEFSECP57772 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
EEFSECP57772 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
EEFSECP57772 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
EEFSECP57772 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
EEFSECP57772 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
EEFSECP57772 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
EEFSECP57772 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
EEFSECP57772 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
EEFSECP57772 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
EEFSECP57772 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
EEFSECP57772 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms