Protein–RNA interactions for Protein: P57059

SIK1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIK1P57059 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SIK1P57059 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SIK1P57059 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SIK1P57059 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
SIK1P57059 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SIK1P57059 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SIK1P57059 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SIK1P57059 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SIK1P57059 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SIK1P57059 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SIK1P57059 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SIK1P57059 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SIK1P57059 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
SIK1P57059 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SIK1P57059 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SIK1P57059 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SIK1P57059 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SIK1P57059 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
SIK1P57059 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SIK1P57059 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SIK1P57059 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SIK1P57059 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SIK1P57059 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SIK1P57059 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SIK1P57059 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SIK1P57059 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SIK1P57059 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SIK1P57059 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
SIK1P57059 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
SIK1P57059 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SIK1P57059 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SIK1P57059 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SIK1P57059 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
SIK1P57059 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SIK1P57059 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SIK1P57059 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
SIK1P57059 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SIK1P57059 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SIK1P57059 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SIK1P57059 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SIK1P57059 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SIK1P57059 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SIK1P57059 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SIK1P57059 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SIK1P57059 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SIK1P57059 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SIK1P57059 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SIK1P57059 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
SIK1P57059 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SIK1P57059 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SIK1P57059 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SIK1P57059 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SIK1P57059 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SIK1P57059 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SIK1P57059 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SIK1P57059 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SIK1P57059 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SIK1P57059 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SIK1P57059 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
SIK1P57059 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SIK1P57059 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SIK1P57059 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SIK1P57059 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SIK1P57059 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SIK1P57059 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SIK1P57059 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SIK1P57059 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SIK1P57059 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SIK1P57059 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SIK1P57059 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SIK1P57059 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SIK1P57059 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SIK1P57059 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SIK1P57059 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SIK1P57059 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SIK1P57059 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SIK1P57059 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
SIK1P57059 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
SIK1P57059 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SIK1P57059 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SIK1P57059 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SIK1P57059 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SIK1P57059 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SIK1P57059 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SIK1P57059 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SIK1P57059 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SIK1P57059 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SIK1P57059 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
SIK1P57059 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SIK1P57059 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
SIK1P57059 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SIK1P57059 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SIK1P57059 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SIK1P57059 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SIK1P57059 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SIK1P57059 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SIK1P57059 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SIK1P57059 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SIK1P57059 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SIK1P57059 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms