Protein–RNA interactions for Protein: P54108

CRISP3, Cysteine-rich secretory protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRISP3P54108 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CRISP3P54108 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CRISP3P54108 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CRISP3P54108 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CRISP3P54108 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CRISP3P54108 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CRISP3P54108 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CRISP3P54108 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CRISP3P54108 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CRISP3P54108 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CRISP3P54108 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CRISP3P54108 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CRISP3P54108 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CRISP3P54108 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CRISP3P54108 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CRISP3P54108 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CRISP3P54108 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CRISP3P54108 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CRISP3P54108 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CRISP3P54108 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CRISP3P54108 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CRISP3P54108 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CRISP3P54108 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CRISP3P54108 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CRISP3P54108 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CRISP3P54108 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CRISP3P54108 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CRISP3P54108 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CRISP3P54108 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CRISP3P54108 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CRISP3P54108 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CRISP3P54108 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CRISP3P54108 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CRISP3P54108 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CRISP3P54108 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CRISP3P54108 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CRISP3P54108 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CRISP3P54108 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CRISP3P54108 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CRISP3P54108 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CRISP3P54108 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CRISP3P54108 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CRISP3P54108 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CRISP3P54108 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CRISP3P54108 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CRISP3P54108 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CRISP3P54108 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CRISP3P54108 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CRISP3P54108 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CRISP3P54108 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CRISP3P54108 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CRISP3P54108 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CRISP3P54108 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CRISP3P54108 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CRISP3P54108 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CRISP3P54108 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CRISP3P54108 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CRISP3P54108 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CRISP3P54108 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CRISP3P54108 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CRISP3P54108 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CRISP3P54108 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CRISP3P54108 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CRISP3P54108 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CRISP3P54108 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CRISP3P54108 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CRISP3P54108 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CRISP3P54108 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CRISP3P54108 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CRISP3P54108 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CRISP3P54108 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CRISP3P54108 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CRISP3P54108 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CRISP3P54108 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CRISP3P54108 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CRISP3P54108 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CRISP3P54108 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CRISP3P54108 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CRISP3P54108 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CRISP3P54108 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CRISP3P54108 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CRISP3P54108 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CRISP3P54108 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CRISP3P54108 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CRISP3P54108 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CRISP3P54108 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CRISP3P54108 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CRISP3P54108 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CRISP3P54108 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CRISP3P54108 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CRISP3P54108 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CRISP3P54108 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CRISP3P54108 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CRISP3P54108 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CRISP3P54108 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CRISP3P54108 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CRISP3P54108 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CRISP3P54108 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CRISP3P54108 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CRISP3P54108 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms