Protein–RNA interactions for Protein: P53847

DSL1, Protein transport protein DSL1, yeast

Predictions only

Length 754 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DSL1	P53847	PCK1	YKR097W	1650 nt		2.73	□□□□□ -1.97
DSL1	P53847	SRB4	YER022W	2064 nt		2.72	□□□□□ -1.97
DSL1	P53847	ROG1	YGL144C	2058 nt		2.72	□□□□□ -1.97
DSL1	P53847	PAU10	YDR542W	363 nt		2.72	□□□□□ -1.97
DSL1	P53847	RPN3	YER021W	1572 nt		2.72	□□□□□ -1.97
DSL1	P53847	PAU11	YGL261C	363 nt		2.72	□□□□□ -1.97
DSL1	P53847	RPS22A	YJL190C	393 nt		2.72	□□□□□ -1.97
DSL1	P53847	PAU4	YLR461W	363 nt		2.72	□□□□□ -1.97
DSL1	P53847	YMR187C	YMR187C	1296 nt		2.72	□□□□□ -1.97
DSL1	P53847	YNL043C	YNL043C	321 nt		2.72	□□□□□ -1.97
DSL1	P53847	NGL1	YOL042W	1092 nt		2.72	□□□□□ -1.97
DSL1	P53847	ARF3	YOR094W	552 nt		2.72	□□□□□ -1.97
DSL1	P53847	YOR283W	YOR283W	693 nt		2.72	□□□□□ -1.97
DSL1	P53847	ISW1	YBR245C	3390 nt		2.72	□□□□□ -1.97
DSL1	P53847	DBF20	YPR111W	1695 nt		2.72	□□□□□ -1.97
DSL1	P53847	VHR2	YER064C	1518 nt		2.72	□□□□□ -1.97
DSL1	P53847	YIL082W-A	YIL082W-A	4497 nt		2.72	□□□□□ -1.97
DSL1	P53847	JJJ2	YJL162C	1752 nt		2.72	□□□□□ -1.97
DSL1	P53847	YKR078W	YKR078W	1758 nt		2.72	□□□□□ -1.97
DSL1	P53847	SAK1	YER129W	3429 nt		2.71	□□□□□ -1.97
DSL1	P53847	SCY1	YGL083W	2415 nt		2.71	□□□□□ -1.98
DSL1	P53847	YDL187C	YDL187C	330 nt		2.71	□□□□□ -1.98
DSL1	P53847	PPH3	YDR075W	927 nt		2.71	□□□□□ -1.98
DSL1	P53847	PEA2	YER149C	1263 nt		2.71	□□□□□ -1.98
DSL1	P53847	RLP24	YLR009W	600 nt		2.71	□□□□□ -1.98
DSL1	P53847	ATG3	YNR007C	933 nt		2.71	□□□□□ -1.98
DSL1	P53847	YDR338C	YDR338C	2088 nt		2.71	□□□□□ -1.98
DSL1	P53847	YEF3	YLR249W	3135 nt		2.71	□□□□□ -1.98
DSL1	P53847	YDR098C-B	YDR098C-B	5268 nt		2.7	□□□□□ -1.98
DSL1	P53847	YDR210C-D	YDR210C-D	5268 nt		2.7	□□□□□ -1.98
DSL1	P53847	YDR316W-B	YDR316W-B	5268 nt		2.7	□□□□□ -1.98
DSL1	P53847	YDR365W-B	YDR365W-B	5268 nt		2.7	□□□□□ -1.98
DSL1	P53847	YER138C	YER138C	5268 nt		2.7	□□□□□ -1.98
DSL1	P53847	YER160C	YER160C	5268 nt		2.7	□□□□□ -1.98
DSL1	P53847	YGR038C-B	YGR038C-B	5268 nt		2.7	□□□□□ -1.98
DSL1	P53847	YGR161C-D	YGR161C-D	5268 nt		2.7	□□□□□ -1.98
DSL1	P53847	YJR027W	YJR027W	5268 nt		2.7	□□□□□ -1.98
DSL1	P53847	YLR157C-B	YLR157C-B	5268 nt		2.7	□□□□□ -1.98
DSL1	P53847	YML039W	YML039W	5268 nt		2.7	□□□□□ -1.98
DSL1	P53847	YML045W	YML045W	5268 nt		2.7	□□□□□ -1.98
DSL1	P53847	YMR050C	YMR050C	5268 nt		2.7	□□□□□ -1.98
DSL1	P53847	YOL103W-B	YOL103W-B	5268 nt		2.7	□□□□□ -1.98
DSL1	P53847	YBR012W-B	YBR012W-B	5271 nt		2.7	□□□□□ -1.98
DSL1	P53847	YOR142W-B	YOR142W-B	5268 nt		2.7	□□□□□ -1.98
DSL1	P53847	YPL257W-B	YPL257W-B	5268 nt		2.7	□□□□□ -1.98
DSL1	P53847	YPR158W-B	YPR158W-B	5271 nt		2.7	□□□□□ -1.98
DSL1	P53847	RLI1	YDR091C	1827 nt		2.7	□□□□□ -1.98
DSL1	P53847	SHE4	YOR035C	2370 nt		2.7	□□□□□ -1.98
DSL1	P53847	YDL016C	YDL016C	303 nt		2.7	□□□□□ -1.98
DSL1	P53847	RPL14B	YHL001W	417 nt		2.7	□□□□□ -1.98
DSL1	P53847	YIL012W	YIL012W	342 nt		2.7	□□□□□ -1.98
DSL1	P53847	CDC123	YLR215C	1083 nt		2.7	□□□□□ -1.98
DSL1	P53847	YLR224W	YLR224W	1110 nt		2.7	□□□□□ -1.98
DSL1	P53847	YNL150W	YNL150W	408 nt		2.7	□□□□□ -1.98
DSL1	P53847	RCN2	YOR220W	798 nt		2.7	□□□□□ -1.98
DSL1	P53847	YPR172W	YPR172W	603 nt		2.7	□□□□□ -1.98
DSL1	P53847	SSP1	YHR184W	1716 nt		2.7	□□□□□ -1.98
DSL1	P53847	ARK1	YNL020C	1917 nt		2.7	□□□□□ -1.98
DSL1	P53847	GAL80	YML051W	1308 nt		2.69	□□□□□ -1.98
DSL1	P53847	SIR3	YLR442C	2937 nt		2.69	□□□□□ -1.98
DSL1	P53847	YKL100C	YKL100C	1764 nt		2.69	□□□□□ -1.98
DSL1	P53847	SLP1	YOR154W	1764 nt		2.69	□□□□□ -1.98
DSL1	P53847	CTF13	YMR094W	1437 nt		2.69	□□□□□ -1.98
DSL1	P53847	YGR228W	YGR228W	345 nt		2.69	□□□□□ -1.98
DSL1	P53847	SCEI	Q0160	708 nt		2.69	□□□□□ -1.98
DSL1	P53847	BAT1	YHR208W	1182 nt		2.69	□□□□□ -1.98
DSL1	P53847	YMR173W-A	YMR173W-A	1185 nt		2.69	□□□□□ -1.98
DSL1	P53847	YMR181C	YMR181C	465 nt		2.69	□□□□□ -1.98
DSL1	P53847	ATP3	YBR039W	936 nt		2.69	□□□□□ -1.98
DSL1	P53847	TAF2	YCR042C	4224 nt		2.69	□□□□□ -1.98
DSL1	P53847	DSF2	YBR007C	2211 nt		2.68	□□□□□ -1.98
DSL1	P53847	YPL216W	YPL216W	3309 nt		2.68	□□□□□ -1.98
DSL1	P53847	SPF1	YEL031W	3648 nt		2.68	□□□□□ -1.98
DSL1	P53847	SLX9	YGR081C	633 nt		2.68	□□□□□ -1.98
DSL1	P53847	TCD1	YHR003C	1290 nt		2.68	□□□□□ -1.98
DSL1	P53847	LRP1	YHR081W	555 nt		2.68	□□□□□ -1.98
DSL1	P53847	YIL054W	YIL054W	318 nt		2.68	□□□□□ -1.98
DSL1	P53847	DAD2	YKR083C	402 nt		2.68	□□□□□ -1.98
DSL1	P53847	SFM1	YOR021C	642 nt		2.68	□□□□□ -1.98
DSL1	P53847	YBR085C-A	YBR085C-A	258 nt		2.68	□□□□□ -1.98
DSL1	P53847	MSB2	YGR014W	3921 nt		2.68	□□□□□ -1.98
DSL1	P53847	SUP56	tL(CAA)A	82 nt		2.67	□□□□□ -1.98
DSL1	P53847	SUP53	tL(CAA)C	82 nt		2.67	□□□□□ -1.98
DSL1	P53847	tL(CAA)D	tL(CAA)D	82 nt		2.67	□□□□□ -1.98
DSL1	P53847	tL(CAA)G1	tL(CAA)G1	82 nt		2.67	□□□□□ -1.98
DSL1	P53847	SUP54	tL(CAA)G2	82 nt		2.67	□□□□□ -1.98
DSL1	P53847	tL(CAA)G3	tL(CAA)G3	82 nt		2.67	□□□□□ -1.98
DSL1	P53847	tL(CAA)K	tL(CAA)K	82 nt		2.67	□□□□□ -1.98
DSL1	P53847	tL(CAA)L	tL(CAA)L	82 nt		2.67	□□□□□ -1.98
DSL1	P53847	tL(CAA)M	tL(CAA)M	82 nt		2.67	□□□□□ -1.98
DSL1	P53847	tL(CAA)N	tL(CAA)N	82 nt		2.67	□□□□□ -1.98
DSL1	P53847	YGR107W	YGR107W	450 nt		2.67	□□□□□ -1.98
DSL1	P53847	YJR141W	YJR141W	1044 nt		2.67	□□□□□ -1.98
DSL1	P53847	CSE4	YKL049C	690 nt		2.67	□□□□□ -1.98
DSL1	P53847	PDP3	YLR455W	915 nt		2.67	□□□□□ -1.98
DSL1	P53847	SWS2	YNL081C	432 nt		2.67	□□□□□ -1.98
DSL1	P53847	YOL085W-A	YOL085W-A	213 nt		2.67	□□□□□ -1.98
DSL1	P53847	YOR169C	YOR169C	465 nt		2.67	□□□□□ -1.98
DSL1	P53847	RBL2	YOR265W	321 nt		2.67	□□□□□ -1.98
DSL1	P53847	YPR014C	YPR014C	330 nt		2.67	□□□□□ -1.98

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