Protein–RNA interactions for Protein: P53396

ACLY, ATP-citrate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACLYP53396 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACLYP53396 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACLYP53396 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACLYP53396 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACLYP53396 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACLYP53396 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACLYP53396 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACLYP53396 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACLYP53396 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACLYP53396 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACLYP53396 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACLYP53396 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACLYP53396 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACLYP53396 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ACLYP53396 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACLYP53396 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACLYP53396 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACLYP53396 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACLYP53396 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACLYP53396 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACLYP53396 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACLYP53396 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACLYP53396 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ACLYP53396 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ACLYP53396 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACLYP53396 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACLYP53396 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACLYP53396 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACLYP53396 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACLYP53396 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ACLYP53396 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACLYP53396 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACLYP53396 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACLYP53396 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ACLYP53396 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACLYP53396 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACLYP53396 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACLYP53396 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACLYP53396 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACLYP53396 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACLYP53396 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACLYP53396 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACLYP53396 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACLYP53396 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACLYP53396 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACLYP53396 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACLYP53396 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ACLYP53396 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACLYP53396 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACLYP53396 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACLYP53396 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACLYP53396 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACLYP53396 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACLYP53396 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACLYP53396 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACLYP53396 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACLYP53396 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACLYP53396 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACLYP53396 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACLYP53396 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACLYP53396 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ACLYP53396 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACLYP53396 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACLYP53396 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACLYP53396 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACLYP53396 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACLYP53396 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACLYP53396 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACLYP53396 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACLYP53396 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ACLYP53396 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACLYP53396 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACLYP53396 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACLYP53396 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACLYP53396 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACLYP53396 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACLYP53396 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACLYP53396 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACLYP53396 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACLYP53396 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACLYP53396 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACLYP53396 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACLYP53396 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACLYP53396 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACLYP53396 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACLYP53396 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACLYP53396 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ACLYP53396 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACLYP53396 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACLYP53396 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACLYP53396 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACLYP53396 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACLYP53396 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACLYP53396 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ACLYP53396 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ACLYP53396 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACLYP53396 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACLYP53396 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACLYP53396 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACLYP53396 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms