Protein–RNA interactions for Protein: P51884

LUM, Lumican, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LUMP51884 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LUMP51884 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LUMP51884 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LUMP51884 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LUMP51884 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LUMP51884 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LUMP51884 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LUMP51884 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LUMP51884 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LUMP51884 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LUMP51884 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LUMP51884 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LUMP51884 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LUMP51884 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LUMP51884 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LUMP51884 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LUMP51884 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LUMP51884 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LUMP51884 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LUMP51884 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LUMP51884 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LUMP51884 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
LUMP51884 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LUMP51884 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LUMP51884 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LUMP51884 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LUMP51884 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LUMP51884 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
LUMP51884 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LUMP51884 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
LUMP51884 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LUMP51884 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
LUMP51884 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LUMP51884 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LUMP51884 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LUMP51884 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LUMP51884 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LUMP51884 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LUMP51884 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LUMP51884 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LUMP51884 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LUMP51884 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LUMP51884 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
LUMP51884 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LUMP51884 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LUMP51884 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LUMP51884 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LUMP51884 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LUMP51884 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LUMP51884 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LUMP51884 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LUMP51884 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LUMP51884 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LUMP51884 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LUMP51884 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LUMP51884 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LUMP51884 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LUMP51884 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
LUMP51884 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LUMP51884 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LUMP51884 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LUMP51884 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LUMP51884 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
LUMP51884 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LUMP51884 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LUMP51884 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LUMP51884 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LUMP51884 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
LUMP51884 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LUMP51884 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LUMP51884 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LUMP51884 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LUMP51884 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LUMP51884 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LUMP51884 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LUMP51884 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LUMP51884 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LUMP51884 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LUMP51884 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LUMP51884 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LUMP51884 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LUMP51884 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LUMP51884 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LUMP51884 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LUMP51884 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LUMP51884 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LUMP51884 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LUMP51884 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LUMP51884 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LUMP51884 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LUMP51884 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
LUMP51884 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
LUMP51884 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LUMP51884 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LUMP51884 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LUMP51884 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LUMP51884 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LUMP51884 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LUMP51884 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LUMP51884 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms