Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DAP3P51398 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DAP3P51398 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DAP3P51398 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DAP3P51398 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DAP3P51398 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DAP3P51398 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DAP3P51398 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DAP3P51398 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DAP3P51398 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DAP3P51398 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DAP3P51398 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DAP3P51398 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DAP3P51398 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DAP3P51398 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
DAP3P51398 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DAP3P51398 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DAP3P51398 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DAP3P51398 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DAP3P51398 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DAP3P51398 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DAP3P51398 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DAP3P51398 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DAP3P51398 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
DAP3P51398 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
DAP3P51398 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DAP3P51398 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DAP3P51398 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DAP3P51398 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DAP3P51398 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DAP3P51398 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DAP3P51398 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DAP3P51398 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DAP3P51398 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DAP3P51398 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DAP3P51398 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
DAP3P51398 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DAP3P51398 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DAP3P51398 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DAP3P51398 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DAP3P51398 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DAP3P51398 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DAP3P51398 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DAP3P51398 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DAP3P51398 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DAP3P51398 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DAP3P51398 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DAP3P51398 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DAP3P51398 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DAP3P51398 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DAP3P51398 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DAP3P51398 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DAP3P51398 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DAP3P51398 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DAP3P51398 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DAP3P51398 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
DAP3P51398 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
DAP3P51398 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DAP3P51398 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DAP3P51398 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DAP3P51398 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DAP3P51398 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DAP3P51398 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DAP3P51398 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DAP3P51398 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DAP3P51398 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DAP3P51398 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DAP3P51398 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DAP3P51398 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DAP3P51398 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DAP3P51398 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DAP3P51398 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DAP3P51398 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DAP3P51398 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DAP3P51398 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DAP3P51398 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DAP3P51398 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DAP3P51398 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DAP3P51398 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DAP3P51398 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DAP3P51398 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DAP3P51398 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DAP3P51398 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DAP3P51398 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DAP3P51398 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DAP3P51398 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DAP3P51398 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DAP3P51398 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DAP3P51398 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DAP3P51398 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DAP3P51398 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DAP3P51398 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DAP3P51398 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DAP3P51398 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DAP3P51398 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DAP3P51398 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DAP3P51398 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DAP3P51398 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DAP3P51398 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DAP3P51398 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms