Protein–RNA interactions for Protein: P49959

MRE11, Double-strand break repair protein MRE11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRE11P49959 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MRE11P49959 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MRE11P49959 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MRE11P49959 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MRE11P49959 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MRE11P49959 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MRE11P49959 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MRE11P49959 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MRE11P49959 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MRE11P49959 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MRE11P49959 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MRE11P49959 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MRE11P49959 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
MRE11P49959 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MRE11P49959 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MRE11P49959 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
MRE11P49959 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
MRE11P49959 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MRE11P49959 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MRE11P49959 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MRE11P49959 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MRE11P49959 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MRE11P49959 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MRE11P49959 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MRE11P49959 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MRE11P49959 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
MRE11P49959 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MRE11P49959 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MRE11P49959 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MRE11P49959 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MRE11P49959 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MRE11P49959 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MRE11P49959 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MRE11P49959 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MRE11P49959 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MRE11P49959 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MRE11P49959 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MRE11P49959 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MRE11P49959 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MRE11P49959 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
MRE11P49959 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
MRE11P49959 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MRE11P49959 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MRE11P49959 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
MRE11P49959 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MRE11P49959 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MRE11P49959 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MRE11P49959 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MRE11P49959 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MRE11P49959 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MRE11P49959 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MRE11P49959 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MRE11P49959 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MRE11P49959 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MRE11P49959 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MRE11P49959 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MRE11P49959 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MRE11P49959 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MRE11P49959 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
MRE11P49959 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MRE11P49959 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MRE11P49959 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MRE11P49959 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MRE11P49959 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MRE11P49959 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MRE11P49959 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MRE11P49959 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MRE11P49959 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MRE11P49959 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MRE11P49959 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MRE11P49959 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MRE11P49959 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MRE11P49959 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MRE11P49959 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MRE11P49959 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MRE11P49959 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MRE11P49959 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
MRE11P49959 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MRE11P49959 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MRE11P49959 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MRE11P49959 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MRE11P49959 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MRE11P49959 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MRE11P49959 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MRE11P49959 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MRE11P49959 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MRE11P49959 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MRE11P49959 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MRE11P49959 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MRE11P49959 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MRE11P49959 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MRE11P49959 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MRE11P49959 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MRE11P49959 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MRE11P49959 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MRE11P49959 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MRE11P49959 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MRE11P49959 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MRE11P49959 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MRE11P49959 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms