Protein–RNA interactions for Protein: P49788

RARRES1, Retinoic acid receptor responder protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARRES1P49788 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RARRES1P49788 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RARRES1P49788 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RARRES1P49788 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RARRES1P49788 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RARRES1P49788 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RARRES1P49788 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RARRES1P49788 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RARRES1P49788 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RARRES1P49788 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RARRES1P49788 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RARRES1P49788 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RARRES1P49788 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RARRES1P49788 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RARRES1P49788 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RARRES1P49788 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RARRES1P49788 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RARRES1P49788 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RARRES1P49788 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RARRES1P49788 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RARRES1P49788 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RARRES1P49788 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RARRES1P49788 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RARRES1P49788 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RARRES1P49788 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RARRES1P49788 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RARRES1P49788 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RARRES1P49788 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RARRES1P49788 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RARRES1P49788 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RARRES1P49788 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RARRES1P49788 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RARRES1P49788 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RARRES1P49788 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RARRES1P49788 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RARRES1P49788 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RARRES1P49788 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RARRES1P49788 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RARRES1P49788 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RARRES1P49788 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RARRES1P49788 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RARRES1P49788 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RARRES1P49788 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RARRES1P49788 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RARRES1P49788 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RARRES1P49788 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RARRES1P49788 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RARRES1P49788 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RARRES1P49788 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RARRES1P49788 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RARRES1P49788 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RARRES1P49788 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RARRES1P49788 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RARRES1P49788 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RARRES1P49788 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RARRES1P49788 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RARRES1P49788 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RARRES1P49788 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RARRES1P49788 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RARRES1P49788 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RARRES1P49788 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RARRES1P49788 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RARRES1P49788 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RARRES1P49788 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RARRES1P49788 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RARRES1P49788 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RARRES1P49788 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RARRES1P49788 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RARRES1P49788 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RARRES1P49788 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RARRES1P49788 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RARRES1P49788 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RARRES1P49788 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RARRES1P49788 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RARRES1P49788 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RARRES1P49788 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RARRES1P49788 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RARRES1P49788 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RARRES1P49788 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RARRES1P49788 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RARRES1P49788 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RARRES1P49788 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RARRES1P49788 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RARRES1P49788 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RARRES1P49788 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RARRES1P49788 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RARRES1P49788 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RARRES1P49788 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RARRES1P49788 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RARRES1P49788 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RARRES1P49788 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RARRES1P49788 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RARRES1P49788 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RARRES1P49788 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RARRES1P49788 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RARRES1P49788 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RARRES1P49788 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RARRES1P49788 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RARRES1P49788 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RARRES1P49788 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms