Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CENPFP49454 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CENPFP49454 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CENPFP49454 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CENPFP49454 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CENPFP49454 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CENPFP49454 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CENPFP49454 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CENPFP49454 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CENPFP49454 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CENPFP49454 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CENPFP49454 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CENPFP49454 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CENPFP49454 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CENPFP49454 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CENPFP49454 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CENPFP49454 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CENPFP49454 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CENPFP49454 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CENPFP49454 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CENPFP49454 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CENPFP49454 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CENPFP49454 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CENPFP49454 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CENPFP49454 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CENPFP49454 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CENPFP49454 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CENPFP49454 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CENPFP49454 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CENPFP49454 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CENPFP49454 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CENPFP49454 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CENPFP49454 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CENPFP49454 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CENPFP49454 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CENPFP49454 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CENPFP49454 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CENPFP49454 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CENPFP49454 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CENPFP49454 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CENPFP49454 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CENPFP49454 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CENPFP49454 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CENPFP49454 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CENPFP49454 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CENPFP49454 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CENPFP49454 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
CENPFP49454 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
CENPFP49454 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
CENPFP49454 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CENPFP49454 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CENPFP49454 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CENPFP49454 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CENPFP49454 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CENPFP49454 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CENPFP49454 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CENPFP49454 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CENPFP49454 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CENPFP49454 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CENPFP49454 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CENPFP49454 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CENPFP49454 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CENPFP49454 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CENPFP49454 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CENPFP49454 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CENPFP49454 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CENPFP49454 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CENPFP49454 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CENPFP49454 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CENPFP49454 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CENPFP49454 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CENPFP49454 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CENPFP49454 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CENPFP49454 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CENPFP49454 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CENPFP49454 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CENPFP49454 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CENPFP49454 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CENPFP49454 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CENPFP49454 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CENPFP49454 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CENPFP49454 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CENPFP49454 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CENPFP49454 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CENPFP49454 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CENPFP49454 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CENPFP49454 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CENPFP49454 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CENPFP49454 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CENPFP49454 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CENPFP49454 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CENPFP49454 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CENPFP49454 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CENPFP49454 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CENPFP49454 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CENPFP49454 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CENPFP49454 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CENPFP49454 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CENPFP49454 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CENPFP49454 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms