Protein–RNA interactions for Protein: P49257

LMAN1, Protein ERGIC-53, humanhuman

Predictions only

Length 510 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN1P49257 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LMAN1P49257 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LMAN1P49257 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LMAN1P49257 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LMAN1P49257 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LMAN1P49257 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LMAN1P49257 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LMAN1P49257 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LMAN1P49257 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LMAN1P49257 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
LMAN1P49257 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LMAN1P49257 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LMAN1P49257 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LMAN1P49257 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LMAN1P49257 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LMAN1P49257 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LMAN1P49257 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LMAN1P49257 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LMAN1P49257 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LMAN1P49257 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LMAN1P49257 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LMAN1P49257 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
LMAN1P49257 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LMAN1P49257 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LMAN1P49257 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
LMAN1P49257 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LMAN1P49257 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LMAN1P49257 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LMAN1P49257 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
LMAN1P49257 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LMAN1P49257 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LMAN1P49257 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LMAN1P49257 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LMAN1P49257 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LMAN1P49257 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LMAN1P49257 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LMAN1P49257 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LMAN1P49257 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LMAN1P49257 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LMAN1P49257 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LMAN1P49257 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LMAN1P49257 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
LMAN1P49257 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
LMAN1P49257 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LMAN1P49257 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMAN1P49257 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMAN1P49257 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMAN1P49257 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMAN1P49257 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMAN1P49257 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMAN1P49257 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMAN1P49257 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMAN1P49257 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMAN1P49257 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
LMAN1P49257 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMAN1P49257 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMAN1P49257 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LMAN1P49257 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LMAN1P49257 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LMAN1P49257 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LMAN1P49257 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LMAN1P49257 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LMAN1P49257 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LMAN1P49257 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LMAN1P49257 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LMAN1P49257 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LMAN1P49257 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LMAN1P49257 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LMAN1P49257 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
LMAN1P49257 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LMAN1P49257 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
LMAN1P49257 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LMAN1P49257 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LMAN1P49257 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LMAN1P49257 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LMAN1P49257 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LMAN1P49257 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LMAN1P49257 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LMAN1P49257 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LMAN1P49257 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
LMAN1P49257 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LMAN1P49257 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LMAN1P49257 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LMAN1P49257 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LMAN1P49257 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LMAN1P49257 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LMAN1P49257 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LMAN1P49257 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LMAN1P49257 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LMAN1P49257 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
LMAN1P49257 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
LMAN1P49257 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LMAN1P49257 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LMAN1P49257 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LMAN1P49257 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LMAN1P49257 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LMAN1P49257 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LMAN1P49257 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LMAN1P49257 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LMAN1P49257 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
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