Protein–RNA interactions for Protein: P48742

LHX1, LIM/homeobox protein Lhx1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX1P48742 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LHX1P48742 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LHX1P48742 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LHX1P48742 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LHX1P48742 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LHX1P48742 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LHX1P48742 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LHX1P48742 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LHX1P48742 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LHX1P48742 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LHX1P48742 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
LHX1P48742 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LHX1P48742 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LHX1P48742 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LHX1P48742 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
LHX1P48742 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LHX1P48742 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LHX1P48742 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LHX1P48742 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LHX1P48742 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LHX1P48742 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LHX1P48742 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LHX1P48742 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LHX1P48742 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
LHX1P48742 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LHX1P48742 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LHX1P48742 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LHX1P48742 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LHX1P48742 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LHX1P48742 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LHX1P48742 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LHX1P48742 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LHX1P48742 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LHX1P48742 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LHX1P48742 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LHX1P48742 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LHX1P48742 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LHX1P48742 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LHX1P48742 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LHX1P48742 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
LHX1P48742 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LHX1P48742 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LHX1P48742 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LHX1P48742 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LHX1P48742 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LHX1P48742 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LHX1P48742 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LHX1P48742 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LHX1P48742 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LHX1P48742 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LHX1P48742 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LHX1P48742 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LHX1P48742 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LHX1P48742 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LHX1P48742 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LHX1P48742 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LHX1P48742 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LHX1P48742 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LHX1P48742 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LHX1P48742 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LHX1P48742 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LHX1P48742 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LHX1P48742 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
LHX1P48742 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LHX1P48742 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LHX1P48742 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LHX1P48742 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LHX1P48742 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LHX1P48742 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LHX1P48742 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LHX1P48742 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LHX1P48742 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LHX1P48742 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LHX1P48742 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LHX1P48742 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LHX1P48742 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LHX1P48742 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
LHX1P48742 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LHX1P48742 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LHX1P48742 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LHX1P48742 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LHX1P48742 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LHX1P48742 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LHX1P48742 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LHX1P48742 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LHX1P48742 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
LHX1P48742 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LHX1P48742 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LHX1P48742 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LHX1P48742 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LHX1P48742 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LHX1P48742 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
LHX1P48742 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LHX1P48742 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LHX1P48742 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LHX1P48742 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LHX1P48742 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LHX1P48742 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LHX1P48742 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LHX1P48742 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms