Protein–RNA interactions for Protein: P48165

GJA8, Gap junction alpha-8 protein, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA8P48165 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GJA8P48165 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GJA8P48165 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GJA8P48165 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GJA8P48165 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GJA8P48165 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GJA8P48165 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
GJA8P48165 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GJA8P48165 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GJA8P48165 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GJA8P48165 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GJA8P48165 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJA8P48165 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJA8P48165 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
GJA8P48165 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJA8P48165 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJA8P48165 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJA8P48165 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJA8P48165 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJA8P48165 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJA8P48165 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJA8P48165 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJA8P48165 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJA8P48165 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJA8P48165 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GJA8P48165 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GJA8P48165 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GJA8P48165 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
GJA8P48165 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
GJA8P48165 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
GJA8P48165 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GJA8P48165 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GJA8P48165 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
GJA8P48165 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GJA8P48165 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GJA8P48165 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GJA8P48165 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GJA8P48165 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GJA8P48165 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GJA8P48165 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GJA8P48165 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GJA8P48165 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GJA8P48165 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GJA8P48165 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GJA8P48165 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GJA8P48165 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GJA8P48165 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GJA8P48165 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GJA8P48165 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GJA8P48165 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GJA8P48165 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GJA8P48165 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GJA8P48165 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GJA8P48165 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GJA8P48165 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GJA8P48165 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GJA8P48165 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GJA8P48165 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GJA8P48165 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GJA8P48165 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GJA8P48165 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GJA8P48165 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GJA8P48165 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GJA8P48165 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GJA8P48165 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GJA8P48165 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GJA8P48165 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GJA8P48165 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GJA8P48165 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GJA8P48165 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GJA8P48165 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GJA8P48165 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GJA8P48165 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GJA8P48165 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GJA8P48165 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GJA8P48165 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GJA8P48165 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GJA8P48165 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GJA8P48165 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GJA8P48165 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GJA8P48165 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GJA8P48165 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GJA8P48165 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GJA8P48165 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GJA8P48165 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GJA8P48165 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GJA8P48165 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GJA8P48165 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GJA8P48165 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GJA8P48165 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GJA8P48165 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GJA8P48165 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GJA8P48165 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GJA8P48165 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GJA8P48165 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GJA8P48165 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GJA8P48165 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GJA8P48165 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GJA8P48165 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GJA8P48165 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms