Protein–RNA interactions for Protein: P42898

MTHFR, Methylenetetrahydrofolate reductase, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFRP42898 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MTHFRP42898 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
MTHFRP42898 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MTHFRP42898 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MTHFRP42898 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MTHFRP42898 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.07
MTHFRP42898 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MTHFRP42898 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MTHFRP42898 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MTHFRP42898 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MTHFRP42898 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MTHFRP42898 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MTHFRP42898 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
MTHFRP42898 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MTHFRP42898 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MTHFRP42898 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MTHFRP42898 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MTHFRP42898 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MTHFRP42898 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MTHFRP42898 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MTHFRP42898 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MTHFRP42898 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MTHFRP42898 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MTHFRP42898 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MTHFRP42898 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MTHFRP42898 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MTHFRP42898 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MTHFRP42898 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MTHFRP42898 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MTHFRP42898 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MTHFRP42898 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MTHFRP42898 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MTHFRP42898 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MTHFRP42898 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MTHFRP42898 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MTHFRP42898 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MTHFRP42898 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MTHFRP42898 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MTHFRP42898 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MTHFRP42898 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MTHFRP42898 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MTHFRP42898 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MTHFRP42898 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
MTHFRP42898 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MTHFRP42898 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MTHFRP42898 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MTHFRP42898 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MTHFRP42898 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MTHFRP42898 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MTHFRP42898 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MTHFRP42898 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MTHFRP42898 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MTHFRP42898 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MTHFRP42898 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MTHFRP42898 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MTHFRP42898 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MTHFRP42898 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MTHFRP42898 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MTHFRP42898 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MTHFRP42898 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MTHFRP42898 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MTHFRP42898 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MTHFRP42898 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MTHFRP42898 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MTHFRP42898 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MTHFRP42898 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MTHFRP42898 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MTHFRP42898 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MTHFRP42898 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MTHFRP42898 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MTHFRP42898 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MTHFRP42898 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MTHFRP42898 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MTHFRP42898 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MTHFRP42898 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MTHFRP42898 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
MTHFRP42898 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MTHFRP42898 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MTHFRP42898 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MTHFRP42898 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MTHFRP42898 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MTHFRP42898 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MTHFRP42898 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MTHFRP42898 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MTHFRP42898 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MTHFRP42898 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MTHFRP42898 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MTHFRP42898 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MTHFRP42898 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MTHFRP42898 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MTHFRP42898 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MTHFRP42898 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MTHFRP42898 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MTHFRP42898 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MTHFRP42898 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MTHFRP42898 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MTHFRP42898 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MTHFRP42898 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MTHFRP42898 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MTHFRP42898 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms