Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FDFT1P37268 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FDFT1P37268 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FDFT1P37268 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FDFT1P37268 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FDFT1P37268 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FDFT1P37268 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FDFT1P37268 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FDFT1P37268 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FDFT1P37268 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FDFT1P37268 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
FDFT1P37268 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FDFT1P37268 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FDFT1P37268 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FDFT1P37268 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FDFT1P37268 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FDFT1P37268 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FDFT1P37268 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FDFT1P37268 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FDFT1P37268 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FDFT1P37268 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FDFT1P37268 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
FDFT1P37268 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FDFT1P37268 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FDFT1P37268 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FDFT1P37268 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FDFT1P37268 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FDFT1P37268 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
FDFT1P37268 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FDFT1P37268 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FDFT1P37268 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FDFT1P37268 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FDFT1P37268 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FDFT1P37268 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FDFT1P37268 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FDFT1P37268 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FDFT1P37268 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FDFT1P37268 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FDFT1P37268 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FDFT1P37268 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FDFT1P37268 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FDFT1P37268 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FDFT1P37268 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FDFT1P37268 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FDFT1P37268 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FDFT1P37268 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FDFT1P37268 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FDFT1P37268 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FDFT1P37268 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FDFT1P37268 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FDFT1P37268 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FDFT1P37268 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FDFT1P37268 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FDFT1P37268 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FDFT1P37268 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FDFT1P37268 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FDFT1P37268 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FDFT1P37268 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FDFT1P37268 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FDFT1P37268 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FDFT1P37268 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
FDFT1P37268 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FDFT1P37268 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
FDFT1P37268 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FDFT1P37268 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FDFT1P37268 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FDFT1P37268 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FDFT1P37268 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FDFT1P37268 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FDFT1P37268 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
FDFT1P37268 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FDFT1P37268 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
FDFT1P37268 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FDFT1P37268 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FDFT1P37268 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FDFT1P37268 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FDFT1P37268 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FDFT1P37268 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FDFT1P37268 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FDFT1P37268 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FDFT1P37268 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
FDFT1P37268 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FDFT1P37268 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FDFT1P37268 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FDFT1P37268 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FDFT1P37268 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FDFT1P37268 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FDFT1P37268 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FDFT1P37268 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FDFT1P37268 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FDFT1P37268 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
FDFT1P37268 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.95
FDFT1P37268 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
FDFT1P37268 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
FDFT1P37268 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
FDFT1P37268 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FDFT1P37268 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FDFT1P37268 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FDFT1P37268 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FDFT1P37268 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms