Protein–RNA interactions for Protein: P36896

ACVR1B, Activin receptor type-1B, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1BP36896 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ACVR1BP36896 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ACVR1BP36896 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ACVR1BP36896 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ACVR1BP36896 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ACVR1BP36896 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ACVR1BP36896 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ACVR1BP36896 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ACVR1BP36896 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ACVR1BP36896 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACVR1BP36896 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACVR1BP36896 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACVR1BP36896 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACVR1BP36896 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACVR1BP36896 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ACVR1BP36896 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACVR1BP36896 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACVR1BP36896 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACVR1BP36896 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACVR1BP36896 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACVR1BP36896 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACVR1BP36896 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACVR1BP36896 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACVR1BP36896 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACVR1BP36896 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACVR1BP36896 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACVR1BP36896 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACVR1BP36896 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACVR1BP36896 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACVR1BP36896 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACVR1BP36896 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACVR1BP36896 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACVR1BP36896 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACVR1BP36896 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACVR1BP36896 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACVR1BP36896 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACVR1BP36896 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACVR1BP36896 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACVR1BP36896 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ACVR1BP36896 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACVR1BP36896 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ACVR1BP36896 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACVR1BP36896 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACVR1BP36896 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACVR1BP36896 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACVR1BP36896 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACVR1BP36896 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACVR1BP36896 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACVR1BP36896 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACVR1BP36896 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACVR1BP36896 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACVR1BP36896 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACVR1BP36896 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACVR1BP36896 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACVR1BP36896 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACVR1BP36896 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACVR1BP36896 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACVR1BP36896 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACVR1BP36896 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACVR1BP36896 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ACVR1BP36896 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACVR1BP36896 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACVR1BP36896 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACVR1BP36896 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACVR1BP36896 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACVR1BP36896 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACVR1BP36896 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ACVR1BP36896 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACVR1BP36896 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACVR1BP36896 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACVR1BP36896 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACVR1BP36896 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACVR1BP36896 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACVR1BP36896 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ACVR1BP36896 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACVR1BP36896 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACVR1BP36896 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACVR1BP36896 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACVR1BP36896 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACVR1BP36896 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACVR1BP36896 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACVR1BP36896 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACVR1BP36896 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACVR1BP36896 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACVR1BP36896 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACVR1BP36896 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACVR1BP36896 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACVR1BP36896 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACVR1BP36896 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACVR1BP36896 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACVR1BP36896 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACVR1BP36896 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACVR1BP36896 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACVR1BP36896 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACVR1BP36896 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACVR1BP36896 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACVR1BP36896 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACVR1BP36896 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACVR1BP36896 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACVR1BP36896 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms