Protein–RNA interactions for Protein: P35663

CYLC1, Cylicin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYLC1P35663 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CYLC1P35663 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CYLC1P35663 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CYLC1P35663 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CYLC1P35663 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CYLC1P35663 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CYLC1P35663 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CYLC1P35663 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYLC1P35663 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYLC1P35663 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CYLC1P35663 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYLC1P35663 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYLC1P35663 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYLC1P35663 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYLC1P35663 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYLC1P35663 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYLC1P35663 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYLC1P35663 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYLC1P35663 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYLC1P35663 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYLC1P35663 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYLC1P35663 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYLC1P35663 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CYLC1P35663 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CYLC1P35663 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CYLC1P35663 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CYLC1P35663 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CYLC1P35663 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CYLC1P35663 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CYLC1P35663 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CYLC1P35663 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CYLC1P35663 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CYLC1P35663 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CYLC1P35663 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CYLC1P35663 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CYLC1P35663 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CYLC1P35663 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CYLC1P35663 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CYLC1P35663 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CYLC1P35663 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CYLC1P35663 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYLC1P35663 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYLC1P35663 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYLC1P35663 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYLC1P35663 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYLC1P35663 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYLC1P35663 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYLC1P35663 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYLC1P35663 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYLC1P35663 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYLC1P35663 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYLC1P35663 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CYLC1P35663 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYLC1P35663 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYLC1P35663 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYLC1P35663 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYLC1P35663 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYLC1P35663 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYLC1P35663 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYLC1P35663 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYLC1P35663 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYLC1P35663 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYLC1P35663 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYLC1P35663 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYLC1P35663 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYLC1P35663 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CYLC1P35663 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CYLC1P35663 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CYLC1P35663 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CYLC1P35663 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CYLC1P35663 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CYLC1P35663 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CYLC1P35663 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CYLC1P35663 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CYLC1P35663 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CYLC1P35663 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CYLC1P35663 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CYLC1P35663 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CYLC1P35663 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CYLC1P35663 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CYLC1P35663 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYLC1P35663 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYLC1P35663 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYLC1P35663 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYLC1P35663 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYLC1P35663 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYLC1P35663 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYLC1P35663 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYLC1P35663 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYLC1P35663 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYLC1P35663 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYLC1P35663 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYLC1P35663 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYLC1P35663 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CYLC1P35663 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYLC1P35663 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYLC1P35663 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYLC1P35663 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYLC1P35663 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYLC1P35663 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms