Protein–RNA interactions for Protein: P35523

CLCN1, Chloride channel protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 988 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN1P35523 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CLCN1P35523 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CLCN1P35523 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CLCN1P35523 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CLCN1P35523 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CLCN1P35523 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLCN1P35523 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLCN1P35523 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLCN1P35523 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLCN1P35523 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLCN1P35523 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLCN1P35523 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLCN1P35523 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLCN1P35523 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLCN1P35523 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLCN1P35523 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLCN1P35523 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLCN1P35523 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLCN1P35523 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLCN1P35523 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLCN1P35523 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLCN1P35523 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLCN1P35523 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLCN1P35523 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLCN1P35523 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLCN1P35523 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLCN1P35523 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLCN1P35523 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLCN1P35523 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLCN1P35523 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLCN1P35523 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLCN1P35523 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLCN1P35523 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLCN1P35523 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLCN1P35523 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLCN1P35523 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLCN1P35523 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLCN1P35523 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLCN1P35523 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLCN1P35523 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLCN1P35523 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLCN1P35523 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLCN1P35523 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLCN1P35523 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLCN1P35523 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLCN1P35523 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLCN1P35523 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLCN1P35523 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLCN1P35523 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLCN1P35523 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLCN1P35523 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLCN1P35523 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLCN1P35523 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLCN1P35523 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLCN1P35523 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLCN1P35523 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLCN1P35523 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLCN1P35523 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLCN1P35523 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLCN1P35523 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLCN1P35523 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLCN1P35523 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLCN1P35523 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLCN1P35523 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLCN1P35523 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLCN1P35523 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLCN1P35523 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLCN1P35523 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLCN1P35523 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CLCN1P35523 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CLCN1P35523 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLCN1P35523 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLCN1P35523 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLCN1P35523 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLCN1P35523 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLCN1P35523 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLCN1P35523 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLCN1P35523 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLCN1P35523 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLCN1P35523 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLCN1P35523 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLCN1P35523 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLCN1P35523 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLCN1P35523 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLCN1P35523 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLCN1P35523 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLCN1P35523 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLCN1P35523 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CLCN1P35523 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLCN1P35523 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLCN1P35523 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLCN1P35523 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLCN1P35523 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLCN1P35523 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLCN1P35523 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLCN1P35523 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CLCN1P35523 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CLCN1P35523 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CLCN1P35523 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CLCN1P35523 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms