Protein–RNA interactions for Protein: P35240

NF2, Merlin, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NF2P35240 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NF2P35240 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NF2P35240 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NF2P35240 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NF2P35240 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NF2P35240 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NF2P35240 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NF2P35240 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NF2P35240 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NF2P35240 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NF2P35240 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NF2P35240 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NF2P35240 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NF2P35240 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NF2P35240 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NF2P35240 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NF2P35240 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NF2P35240 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NF2P35240 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NF2P35240 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NF2P35240 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NF2P35240 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NF2P35240 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NF2P35240 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NF2P35240 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NF2P35240 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NF2P35240 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NF2P35240 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NF2P35240 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NF2P35240 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NF2P35240 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NF2P35240 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NF2P35240 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NF2P35240 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NF2P35240 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NF2P35240 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NF2P35240 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NF2P35240 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NF2P35240 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NF2P35240 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NF2P35240 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NF2P35240 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NF2P35240 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NF2P35240 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NF2P35240 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NF2P35240 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NF2P35240 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NF2P35240 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NF2P35240 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
NF2P35240 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
NF2P35240 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NF2P35240 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NF2P35240 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NF2P35240 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NF2P35240 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NF2P35240 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NF2P35240 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NF2P35240 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NF2P35240 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NF2P35240 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NF2P35240 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NF2P35240 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NF2P35240 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NF2P35240 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NF2P35240 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NF2P35240 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NF2P35240 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NF2P35240 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NF2P35240 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NF2P35240 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NF2P35240 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NF2P35240 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NF2P35240 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NF2P35240 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NF2P35240 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NF2P35240 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NF2P35240 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NF2P35240 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NF2P35240 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NF2P35240 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NF2P35240 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NF2P35240 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NF2P35240 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NF2P35240 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NF2P35240 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NF2P35240 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NF2P35240 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NF2P35240 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NF2P35240 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NF2P35240 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NF2P35240 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NF2P35240 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NF2P35240 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NF2P35240 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NF2P35240 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NF2P35240 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NF2P35240 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NF2P35240 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NF2P35240 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NF2P35240 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms