Protein–RNA interactions for Protein: P32456

GBP2, Guanylate-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP2P32456 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GBP2P32456 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GBP2P32456 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GBP2P32456 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GBP2P32456 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GBP2P32456 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GBP2P32456 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GBP2P32456 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GBP2P32456 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GBP2P32456 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GBP2P32456 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GBP2P32456 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GBP2P32456 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GBP2P32456 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GBP2P32456 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GBP2P32456 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GBP2P32456 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GBP2P32456 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GBP2P32456 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GBP2P32456 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
GBP2P32456 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
GBP2P32456 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
GBP2P32456 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
GBP2P32456 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GBP2P32456 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GBP2P32456 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GBP2P32456 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GBP2P32456 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GBP2P32456 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GBP2P32456 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GBP2P32456 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GBP2P32456 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GBP2P32456 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GBP2P32456 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GBP2P32456 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GBP2P32456 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GBP2P32456 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GBP2P32456 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GBP2P32456 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GBP2P32456 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GBP2P32456 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GBP2P32456 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GBP2P32456 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GBP2P32456 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GBP2P32456 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GBP2P32456 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GBP2P32456 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GBP2P32456 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GBP2P32456 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GBP2P32456 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GBP2P32456 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GBP2P32456 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GBP2P32456 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GBP2P32456 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GBP2P32456 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GBP2P32456 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GBP2P32456 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GBP2P32456 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GBP2P32456 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GBP2P32456 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GBP2P32456 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GBP2P32456 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GBP2P32456 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GBP2P32456 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GBP2P32456 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GBP2P32456 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GBP2P32456 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GBP2P32456 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GBP2P32456 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GBP2P32456 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GBP2P32456 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GBP2P32456 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GBP2P32456 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GBP2P32456 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GBP2P32456 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GBP2P32456 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GBP2P32456 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GBP2P32456 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GBP2P32456 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GBP2P32456 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GBP2P32456 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GBP2P32456 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GBP2P32456 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GBP2P32456 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GBP2P32456 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GBP2P32456 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GBP2P32456 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GBP2P32456 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GBP2P32456 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GBP2P32456 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GBP2P32456 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GBP2P32456 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GBP2P32456 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GBP2P32456 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GBP2P32456 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GBP2P32456 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GBP2P32456 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GBP2P32456 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GBP2P32456 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GBP2P32456 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms