Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSPOP30536 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSPOP30536 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSPOP30536 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSPOP30536 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSPOP30536 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSPOP30536 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSPOP30536 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSPOP30536 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSPOP30536 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSPOP30536 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TSPOP30536 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSPOP30536 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSPOP30536 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSPOP30536 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSPOP30536 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSPOP30536 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSPOP30536 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSPOP30536 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSPOP30536 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSPOP30536 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSPOP30536 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSPOP30536 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSPOP30536 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TSPOP30536 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSPOP30536 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSPOP30536 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSPOP30536 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSPOP30536 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSPOP30536 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSPOP30536 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSPOP30536 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSPOP30536 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSPOP30536 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSPOP30536 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSPOP30536 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSPOP30536 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSPOP30536 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSPOP30536 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSPOP30536 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSPOP30536 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSPOP30536 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSPOP30536 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSPOP30536 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSPOP30536 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSPOP30536 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSPOP30536 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSPOP30536 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSPOP30536 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSPOP30536 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSPOP30536 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSPOP30536 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSPOP30536 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TSPOP30536 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSPOP30536 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSPOP30536 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSPOP30536 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSPOP30536 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSPOP30536 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSPOP30536 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TSPOP30536 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSPOP30536 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSPOP30536 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSPOP30536 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSPOP30536 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSPOP30536 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSPOP30536 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSPOP30536 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSPOP30536 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSPOP30536 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSPOP30536 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSPOP30536 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSPOP30536 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSPOP30536 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSPOP30536 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSPOP30536 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSPOP30536 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSPOP30536 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSPOP30536 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSPOP30536 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSPOP30536 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSPOP30536 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSPOP30536 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSPOP30536 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSPOP30536 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSPOP30536 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TSPOP30536 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSPOP30536 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSPOP30536 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSPOP30536 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSPOP30536 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TSPOP30536 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSPOP30536 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSPOP30536 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSPOP30536 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSPOP30536 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSPOP30536 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TSPOP30536 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSPOP30536 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TSPOP30536 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms