Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CASP1P29466 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CASP1P29466 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CASP1P29466 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CASP1P29466 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CASP1P29466 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CASP1P29466 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CASP1P29466 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CASP1P29466 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CASP1P29466 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CASP1P29466 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CASP1P29466 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CASP1P29466 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CASP1P29466 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CASP1P29466 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CASP1P29466 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CASP1P29466 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CASP1P29466 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CASP1P29466 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CASP1P29466 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CASP1P29466 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CASP1P29466 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CASP1P29466 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CASP1P29466 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CASP1P29466 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CASP1P29466 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CASP1P29466 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CASP1P29466 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CASP1P29466 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CASP1P29466 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CASP1P29466 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CASP1P29466 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CASP1P29466 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CASP1P29466 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CASP1P29466 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CASP1P29466 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CASP1P29466 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CASP1P29466 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CASP1P29466 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CASP1P29466 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CASP1P29466 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CASP1P29466 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CASP1P29466 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CASP1P29466 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CASP1P29466 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CASP1P29466 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CASP1P29466 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CASP1P29466 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CASP1P29466 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CASP1P29466 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CASP1P29466 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CASP1P29466 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CASP1P29466 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CASP1P29466 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CASP1P29466 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CASP1P29466 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CASP1P29466 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CASP1P29466 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CASP1P29466 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CASP1P29466 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CASP1P29466 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CASP1P29466 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CASP1P29466 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CASP1P29466 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CASP1P29466 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CASP1P29466 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CASP1P29466 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CASP1P29466 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CASP1P29466 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CASP1P29466 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CASP1P29466 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CASP1P29466 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CASP1P29466 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CASP1P29466 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CASP1P29466 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CASP1P29466 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CASP1P29466 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CASP1P29466 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CASP1P29466 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CASP1P29466 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CASP1P29466 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CASP1P29466 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CASP1P29466 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CASP1P29466 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CASP1P29466 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CASP1P29466 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CASP1P29466 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CASP1P29466 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CASP1P29466 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CASP1P29466 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CASP1P29466 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CASP1P29466 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CASP1P29466 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CASP1P29466 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CASP1P29466 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CASP1P29466 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CASP1P29466 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CASP1P29466 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CASP1P29466 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CASP1P29466 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms