Protein–RNA interactions for Protein: P29400

COL4A5, Collagen alpha-5(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A5P29400 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
COL4A5P29400 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
COL4A5P29400 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
COL4A5P29400 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
COL4A5P29400 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
COL4A5P29400 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
COL4A5P29400 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
COL4A5P29400 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
COL4A5P29400 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
COL4A5P29400 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
COL4A5P29400 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
COL4A5P29400 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
COL4A5P29400 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
COL4A5P29400 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
COL4A5P29400 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
COL4A5P29400 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
COL4A5P29400 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
COL4A5P29400 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
COL4A5P29400 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
COL4A5P29400 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
COL4A5P29400 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
COL4A5P29400 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
COL4A5P29400 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
COL4A5P29400 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
COL4A5P29400 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
COL4A5P29400 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
COL4A5P29400 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
COL4A5P29400 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
COL4A5P29400 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
COL4A5P29400 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
COL4A5P29400 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
COL4A5P29400 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
COL4A5P29400 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
COL4A5P29400 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
COL4A5P29400 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
COL4A5P29400 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
COL4A5P29400 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
COL4A5P29400 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
COL4A5P29400 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
COL4A5P29400 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
COL4A5P29400 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
COL4A5P29400 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
COL4A5P29400 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
COL4A5P29400 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
COL4A5P29400 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
COL4A5P29400 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
COL4A5P29400 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
COL4A5P29400 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
COL4A5P29400 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
COL4A5P29400 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
COL4A5P29400 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
COL4A5P29400 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
COL4A5P29400 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
COL4A5P29400 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
COL4A5P29400 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
COL4A5P29400 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
COL4A5P29400 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
COL4A5P29400 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
COL4A5P29400 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
COL4A5P29400 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
COL4A5P29400 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
COL4A5P29400 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
COL4A5P29400 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
COL4A5P29400 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
COL4A5P29400 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
COL4A5P29400 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
COL4A5P29400 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
COL4A5P29400 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
COL4A5P29400 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
COL4A5P29400 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
COL4A5P29400 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
COL4A5P29400 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
COL4A5P29400 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
COL4A5P29400 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
COL4A5P29400 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
COL4A5P29400 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
COL4A5P29400 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
COL4A5P29400 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
COL4A5P29400 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
COL4A5P29400 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
COL4A5P29400 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
COL4A5P29400 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
COL4A5P29400 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
COL4A5P29400 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
COL4A5P29400 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
COL4A5P29400 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
COL4A5P29400 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
COL4A5P29400 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
COL4A5P29400 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
COL4A5P29400 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
COL4A5P29400 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
COL4A5P29400 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
COL4A5P29400 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
COL4A5P29400 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
COL4A5P29400 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
COL4A5P29400 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
COL4A5P29400 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
COL4A5P29400 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
COL4A5P29400 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
COL4A5P29400 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms