Protein–RNA interactions for Protein: P29376

LTK, Leukocyte tyrosine kinase receptor, humanhuman

Predictions only

Length 864 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTKP29376 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
LTKP29376 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
LTKP29376 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
LTKP29376 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
LTKP29376 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
LTKP29376 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
LTKP29376 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
LTKP29376 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
LTKP29376 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
LTKP29376 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
LTKP29376 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
LTKP29376 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
LTKP29376 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
LTKP29376 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
LTKP29376 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
LTKP29376 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
LTKP29376 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
LTKP29376 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
LTKP29376 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
LTKP29376 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
LTKP29376 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
LTKP29376 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
LTKP29376 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
LTKP29376 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
LTKP29376 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
LTKP29376 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
LTKP29376 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
LTKP29376 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
LTKP29376 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
LTKP29376 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
LTKP29376 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
LTKP29376 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
LTKP29376 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
LTKP29376 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
LTKP29376 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
LTKP29376 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
LTKP29376 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
LTKP29376 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC29.61■■■□□ 2.33
LTKP29376 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
LTKP29376 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
LTKP29376 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
LTKP29376 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
LTKP29376 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
LTKP29376 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
LTKP29376 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
LTKP29376 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC29.6■■■□□ 2.33
LTKP29376 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
LTKP29376 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
LTKP29376 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
LTKP29376 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
LTKP29376 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
LTKP29376 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
LTKP29376 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
LTKP29376 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
LTKP29376 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
LTKP29376 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
LTKP29376 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
LTKP29376 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
LTKP29376 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
LTKP29376 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
LTKP29376 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
LTKP29376 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
LTKP29376 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
LTKP29376 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
LTKP29376 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
LTKP29376 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
LTKP29376 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
LTKP29376 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
LTKP29376 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
LTKP29376 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
LTKP29376 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
LTKP29376 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
LTKP29376 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
LTKP29376 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
LTKP29376 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
LTKP29376 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
LTKP29376 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
LTKP29376 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
LTKP29376 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
LTKP29376 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC29.58■■■□□ 2.33
LTKP29376 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
LTKP29376 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
LTKP29376 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
LTKP29376 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
LTKP29376 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
LTKP29376 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
LTKP29376 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
LTKP29376 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
LTKP29376 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
LTKP29376 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
LTKP29376 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
LTKP29376 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
LTKP29376 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
LTKP29376 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
LTKP29376 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
LTKP29376 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
LTKP29376 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
LTKP29376 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
LTKP29376 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
LTKP29376 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms