Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
PTPRMP28827 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
PTPRMP28827 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
PTPRMP28827 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
PTPRMP28827 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
PTPRMP28827 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
PTPRMP28827 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
PTPRMP28827 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
PTPRMP28827 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
PTPRMP28827 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
PTPRMP28827 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
PTPRMP28827 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC30.72■■■□□ 2.51
PTPRMP28827 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
PTPRMP28827 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
PTPRMP28827 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
PTPRMP28827 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
PTPRMP28827 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
PTPRMP28827 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
PTPRMP28827 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
PTPRMP28827 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
PTPRMP28827 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
PTPRMP28827 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
PTPRMP28827 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
PTPRMP28827 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
PTPRMP28827 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
PTPRMP28827 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
PTPRMP28827 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
PTPRMP28827 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
PTPRMP28827 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC30.7■■■□□ 2.51
PTPRMP28827 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC30.7■■■□□ 2.51
PTPRMP28827 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
PTPRMP28827 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
PTPRMP28827 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
PTPRMP28827 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC30.7■■■□□ 2.51
PTPRMP28827 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
PTPRMP28827 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
PTPRMP28827 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.5
PTPRMP28827 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.5
PTPRMP28827 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
PTPRMP28827 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.5
PTPRMP28827 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.5
PTPRMP28827 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
PTPRMP28827 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC30.69■■■□□ 2.5
PTPRMP28827 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
PTPRMP28827 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC30.69■■■□□ 2.5
PTPRMP28827 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
PTPRMP28827 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
PTPRMP28827 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC30.69■■■□□ 2.5
PTPRMP28827 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
PTPRMP28827 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
PTPRMP28827 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
PTPRMP28827 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
PTPRMP28827 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
PTPRMP28827 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
PTPRMP28827 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
PTPRMP28827 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
PTPRMP28827 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
PTPRMP28827 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
PTPRMP28827 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
PTPRMP28827 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
PTPRMP28827 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
PTPRMP28827 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
PTPRMP28827 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
PTPRMP28827 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
PTPRMP28827 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
PTPRMP28827 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
PTPRMP28827 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
PTPRMP28827 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC30.67■■■□□ 2.5
PTPRMP28827 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
PTPRMP28827 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
PTPRMP28827 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
PTPRMP28827 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
PTPRMP28827 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
PTPRMP28827 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
PTPRMP28827 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
PTPRMP28827 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
PTPRMP28827 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
PTPRMP28827 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
PTPRMP28827 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
PTPRMP28827 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
PTPRMP28827 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
PTPRMP28827 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
PTPRMP28827 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
PTPRMP28827 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
PTPRMP28827 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
PTPRMP28827 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.65■■■□□ 2.5
PTPRMP28827 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC30.65■■■□□ 2.5
PTPRMP28827 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC30.65■■■□□ 2.5
PTPRMP28827 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
PTPRMP28827 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
PTPRMP28827 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
PTPRMP28827 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
PTPRMP28827 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
PTPRMP28827 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
PTPRMP28827 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
PTPRMP28827 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
PTPRMP28827 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
PTPRMP28827 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
PTPRMP28827 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
PTPRMP28827 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.49
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