Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GCAP28676 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GCAP28676 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GCAP28676 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GCAP28676 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GCAP28676 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GCAP28676 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GCAP28676 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GCAP28676 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GCAP28676 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GCAP28676 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GCAP28676 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
GCAP28676 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GCAP28676 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GCAP28676 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GCAP28676 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
GCAP28676 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GCAP28676 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GCAP28676 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GCAP28676 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GCAP28676 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GCAP28676 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GCAP28676 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GCAP28676 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GCAP28676 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GCAP28676 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GCAP28676 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GCAP28676 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GCAP28676 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GCAP28676 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GCAP28676 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GCAP28676 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GCAP28676 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GCAP28676 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GCAP28676 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GCAP28676 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GCAP28676 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GCAP28676 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GCAP28676 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GCAP28676 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GCAP28676 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GCAP28676 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.91
GCAP28676 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.7■□□□□ 0.91
GCAP28676 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.91
GCAP28676 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GCAP28676 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GCAP28676 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GCAP28676 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GCAP28676 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GCAP28676 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GCAP28676 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GCAP28676 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GCAP28676 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GCAP28676 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GCAP28676 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GCAP28676 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GCAP28676 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GCAP28676 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GCAP28676 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GCAP28676 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GCAP28676 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GCAP28676 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GCAP28676 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GCAP28676 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GCAP28676 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
GCAP28676 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GCAP28676 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GCAP28676 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GCAP28676 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.69■□□□□ 0.9
GCAP28676 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
GCAP28676 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
GCAP28676 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
GCAP28676 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
GCAP28676 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
GCAP28676 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GCAP28676 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
GCAP28676 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
GCAP28676 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GCAP28676 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
GCAP28676 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GCAP28676 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GCAP28676 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GCAP28676 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
GCAP28676 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GCAP28676 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GCAP28676 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GCAP28676 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
GCAP28676 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
GCAP28676 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
GCAP28676 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
GCAP28676 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
GCAP28676 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GCAP28676 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
GCAP28676 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GCAP28676 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
GCAP28676 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GCAP28676 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
GCAP28676 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GCAP28676 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
GCAP28676 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms