Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXD10P28358 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXD10P28358 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXD10P28358 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXD10P28358 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXD10P28358 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXD10P28358 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXD10P28358 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXD10P28358 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXD10P28358 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXD10P28358 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXD10P28358 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXD10P28358 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXD10P28358 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXD10P28358 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXD10P28358 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXD10P28358 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXD10P28358 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXD10P28358 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXD10P28358 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXD10P28358 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXD10P28358 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXD10P28358 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXD10P28358 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXD10P28358 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXD10P28358 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXD10P28358 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXD10P28358 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXD10P28358 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXD10P28358 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXD10P28358 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXD10P28358 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXD10P28358 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXD10P28358 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXD10P28358 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXD10P28358 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXD10P28358 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXD10P28358 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXD10P28358 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXD10P28358 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXD10P28358 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXD10P28358 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXD10P28358 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXD10P28358 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXD10P28358 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXD10P28358 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXD10P28358 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXD10P28358 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXD10P28358 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXD10P28358 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXD10P28358 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXD10P28358 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXD10P28358 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXD10P28358 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXD10P28358 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXD10P28358 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXD10P28358 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXD10P28358 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXD10P28358 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXD10P28358 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXD10P28358 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXD10P28358 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXD10P28358 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXD10P28358 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXD10P28358 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXD10P28358 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXD10P28358 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXD10P28358 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXD10P28358 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXD10P28358 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXD10P28358 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXD10P28358 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXD10P28358 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXD10P28358 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXD10P28358 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXD10P28358 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXD10P28358 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXD10P28358 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXD10P28358 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXD10P28358 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXD10P28358 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXD10P28358 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXD10P28358 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXD10P28358 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXD10P28358 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXD10P28358 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXD10P28358 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXD10P28358 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
HOXD10P28358 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
HOXD10P28358 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
HOXD10P28358 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
HOXD10P28358 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXD10P28358 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXD10P28358 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXD10P28358 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXD10P28358 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXD10P28358 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXD10P28358 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXD10P28358 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXD10P28358 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms