Protein–RNA interactions for Protein: P28074

PSMB5, Proteasome subunit beta type-5, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB5P28074 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSMB5P28074 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSMB5P28074 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSMB5P28074 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSMB5P28074 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSMB5P28074 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSMB5P28074 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSMB5P28074 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSMB5P28074 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PSMB5P28074 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSMB5P28074 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSMB5P28074 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSMB5P28074 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSMB5P28074 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSMB5P28074 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSMB5P28074 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSMB5P28074 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSMB5P28074 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSMB5P28074 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSMB5P28074 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSMB5P28074 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSMB5P28074 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSMB5P28074 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSMB5P28074 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSMB5P28074 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSMB5P28074 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSMB5P28074 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSMB5P28074 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSMB5P28074 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSMB5P28074 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSMB5P28074 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSMB5P28074 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSMB5P28074 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSMB5P28074 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSMB5P28074 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSMB5P28074 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSMB5P28074 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSMB5P28074 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSMB5P28074 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSMB5P28074 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSMB5P28074 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSMB5P28074 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSMB5P28074 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PSMB5P28074 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PSMB5P28074 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PSMB5P28074 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PSMB5P28074 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PSMB5P28074 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PSMB5P28074 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PSMB5P28074 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PSMB5P28074 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PSMB5P28074 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PSMB5P28074 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PSMB5P28074 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PSMB5P28074 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
PSMB5P28074 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PSMB5P28074 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PSMB5P28074 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PSMB5P28074 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PSMB5P28074 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PSMB5P28074 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PSMB5P28074 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
PSMB5P28074 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PSMB5P28074 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PSMB5P28074 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PSMB5P28074 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PSMB5P28074 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PSMB5P28074 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PSMB5P28074 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PSMB5P28074 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PSMB5P28074 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PSMB5P28074 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PSMB5P28074 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PSMB5P28074 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PSMB5P28074 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PSMB5P28074 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PSMB5P28074 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PSMB5P28074 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PSMB5P28074 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PSMB5P28074 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PSMB5P28074 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PSMB5P28074 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PSMB5P28074 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PSMB5P28074 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PSMB5P28074 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PSMB5P28074 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PSMB5P28074 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PSMB5P28074 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PSMB5P28074 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
PSMB5P28074 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PSMB5P28074 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PSMB5P28074 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PSMB5P28074 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PSMB5P28074 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PSMB5P28074 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PSMB5P28074 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PSMB5P28074 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PSMB5P28074 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
PSMB5P28074 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PSMB5P28074 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms