Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMB9P28065 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMB9P28065 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMB9P28065 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMB9P28065 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMB9P28065 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMB9P28065 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMB9P28065 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMB9P28065 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMB9P28065 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMB9P28065 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSMB9P28065 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMB9P28065 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMB9P28065 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMB9P28065 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMB9P28065 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMB9P28065 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMB9P28065 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMB9P28065 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMB9P28065 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMB9P28065 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMB9P28065 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMB9P28065 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMB9P28065 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMB9P28065 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMB9P28065 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMB9P28065 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMB9P28065 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMB9P28065 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMB9P28065 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMB9P28065 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PSMB9P28065 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMB9P28065 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMB9P28065 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMB9P28065 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMB9P28065 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMB9P28065 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMB9P28065 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMB9P28065 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMB9P28065 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMB9P28065 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMB9P28065 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMB9P28065 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMB9P28065 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMB9P28065 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMB9P28065 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMB9P28065 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMB9P28065 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMB9P28065 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMB9P28065 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMB9P28065 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMB9P28065 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMB9P28065 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMB9P28065 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMB9P28065 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMB9P28065 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMB9P28065 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMB9P28065 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMB9P28065 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMB9P28065 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMB9P28065 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMB9P28065 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMB9P28065 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMB9P28065 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PSMB9P28065 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PSMB9P28065 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PSMB9P28065 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PSMB9P28065 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PSMB9P28065 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PSMB9P28065 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PSMB9P28065 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PSMB9P28065 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PSMB9P28065 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PSMB9P28065 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PSMB9P28065 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PSMB9P28065 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PSMB9P28065 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PSMB9P28065 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PSMB9P28065 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PSMB9P28065 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
PSMB9P28065 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PSMB9P28065 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PSMB9P28065 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PSMB9P28065 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PSMB9P28065 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PSMB9P28065 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PSMB9P28065 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PSMB9P28065 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PSMB9P28065 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PSMB9P28065 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PSMB9P28065 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PSMB9P28065 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PSMB9P28065 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PSMB9P28065 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PSMB9P28065 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PSMB9P28065 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PSMB9P28065 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PSMB9P28065 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PSMB9P28065 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PSMB9P28065 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms