Protein–RNA interactions for Protein: P24539

ATP5F1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5F1P24539 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP5F1P24539 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP5F1P24539 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP5F1P24539 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP5F1P24539 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP5F1P24539 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP5F1P24539 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP5F1P24539 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP5F1P24539 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP5F1P24539 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP5F1P24539 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP5F1P24539 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP5F1P24539 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP5F1P24539 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP5F1P24539 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP5F1P24539 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP5F1P24539 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP5F1P24539 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP5F1P24539 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP5F1P24539 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP5F1P24539 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP5F1P24539 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP5F1P24539 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP5F1P24539 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP5F1P24539 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP5F1P24539 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP5F1P24539 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP5F1P24539 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP5F1P24539 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP5F1P24539 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP5F1P24539 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP5F1P24539 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP5F1P24539 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP5F1P24539 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP5F1P24539 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP5F1P24539 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP5F1P24539 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP5F1P24539 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP5F1P24539 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP5F1P24539 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP5F1P24539 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP5F1P24539 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP5F1P24539 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP5F1P24539 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP5F1P24539 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP5F1P24539 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATP5F1P24539 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATP5F1P24539 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATP5F1P24539 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATP5F1P24539 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATP5F1P24539 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATP5F1P24539 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATP5F1P24539 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATP5F1P24539 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATP5F1P24539 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATP5F1P24539 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATP5F1P24539 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATP5F1P24539 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATP5F1P24539 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ATP5F1P24539 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ATP5F1P24539 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATP5F1P24539 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATP5F1P24539 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATP5F1P24539 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATP5F1P24539 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ATP5F1P24539 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ATP5F1P24539 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ATP5F1P24539 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ATP5F1P24539 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ATP5F1P24539 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP5F1P24539 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP5F1P24539 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP5F1P24539 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP5F1P24539 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP5F1P24539 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP5F1P24539 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP5F1P24539 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP5F1P24539 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP5F1P24539 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP5F1P24539 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP5F1P24539 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP5F1P24539 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP5F1P24539 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP5F1P24539 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP5F1P24539 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP5F1P24539 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP5F1P24539 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP5F1P24539 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP5F1P24539 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP5F1P24539 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP5F1P24539 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP5F1P24539 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP5F1P24539 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP5F1P24539 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP5F1P24539 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP5F1P24539 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP5F1P24539 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP5F1P24539 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP5F1P24539 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP5F1P24539 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms