Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VAMP1P23763 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VAMP1P23763 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VAMP1P23763 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
VAMP1P23763 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VAMP1P23763 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VAMP1P23763 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VAMP1P23763 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VAMP1P23763 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VAMP1P23763 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VAMP1P23763 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VAMP1P23763 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VAMP1P23763 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VAMP1P23763 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VAMP1P23763 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VAMP1P23763 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VAMP1P23763 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VAMP1P23763 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VAMP1P23763 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VAMP1P23763 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VAMP1P23763 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VAMP1P23763 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VAMP1P23763 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VAMP1P23763 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
VAMP1P23763 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VAMP1P23763 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
VAMP1P23763 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VAMP1P23763 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VAMP1P23763 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VAMP1P23763 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VAMP1P23763 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VAMP1P23763 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VAMP1P23763 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VAMP1P23763 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VAMP1P23763 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
VAMP1P23763 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VAMP1P23763 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VAMP1P23763 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VAMP1P23763 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VAMP1P23763 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VAMP1P23763 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VAMP1P23763 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VAMP1P23763 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VAMP1P23763 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VAMP1P23763 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
VAMP1P23763 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VAMP1P23763 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VAMP1P23763 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VAMP1P23763 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VAMP1P23763 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VAMP1P23763 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VAMP1P23763 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VAMP1P23763 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
VAMP1P23763 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VAMP1P23763 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VAMP1P23763 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VAMP1P23763 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
VAMP1P23763 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
VAMP1P23763 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VAMP1P23763 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VAMP1P23763 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
VAMP1P23763 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VAMP1P23763 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VAMP1P23763 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VAMP1P23763 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VAMP1P23763 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VAMP1P23763 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VAMP1P23763 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VAMP1P23763 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VAMP1P23763 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VAMP1P23763 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VAMP1P23763 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VAMP1P23763 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VAMP1P23763 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VAMP1P23763 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VAMP1P23763 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VAMP1P23763 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VAMP1P23763 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VAMP1P23763 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VAMP1P23763 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VAMP1P23763 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VAMP1P23763 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VAMP1P23763 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VAMP1P23763 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VAMP1P23763 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VAMP1P23763 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VAMP1P23763 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VAMP1P23763 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VAMP1P23763 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
VAMP1P23763 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
VAMP1P23763 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
VAMP1P23763 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VAMP1P23763 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VAMP1P23763 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VAMP1P23763 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VAMP1P23763 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VAMP1P23763 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VAMP1P23763 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VAMP1P23763 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VAMP1P23763 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms