Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
PTPRGP23470 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC32.92■■■□□ 2.86
PTPRGP23470 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
PTPRGP23470 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
PTPRGP23470 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
PTPRGP23470 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
PTPRGP23470 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
PTPRGP23470 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.91■■■□□ 2.86
PTPRGP23470 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
PTPRGP23470 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
PTPRGP23470 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
PTPRGP23470 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
PTPRGP23470 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
PTPRGP23470 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC32.9■■■□□ 2.86
PTPRGP23470 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
PTPRGP23470 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC32.9■■■□□ 2.86
PTPRGP23470 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
PTPRGP23470 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
PTPRGP23470 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
PTPRGP23470 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
PTPRGP23470 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
PTPRGP23470 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
PTPRGP23470 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
PTPRGP23470 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
PTPRGP23470 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC32.89■■■□□ 2.86
PTPRGP23470 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
PTPRGP23470 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
PTPRGP23470 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.88■■■□□ 2.85
PTPRGP23470 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
PTPRGP23470 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
PTPRGP23470 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
PTPRGP23470 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
PTPRGP23470 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
PTPRGP23470 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
PTPRGP23470 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
PTPRGP23470 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
PTPRGP23470 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
PTPRGP23470 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
PTPRGP23470 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
PTPRGP23470 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
PTPRGP23470 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC32.87■■■□□ 2.85
PTPRGP23470 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
PTPRGP23470 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
PTPRGP23470 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
PTPRGP23470 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
PTPRGP23470 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
PTPRGP23470 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
PTPRGP23470 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
PTPRGP23470 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
PTPRGP23470 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
PTPRGP23470 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
PTPRGP23470 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC32.86■■■□□ 2.85
PTPRGP23470 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
PTPRGP23470 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
PTPRGP23470 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
PTPRGP23470 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
PTPRGP23470 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
PTPRGP23470 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
PTPRGP23470 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
PTPRGP23470 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
PTPRGP23470 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
PTPRGP23470 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
PTPRGP23470 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC32.85■■■□□ 2.85
PTPRGP23470 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
PTPRGP23470 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
PTPRGP23470 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
PTPRGP23470 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
PTPRGP23470 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
PTPRGP23470 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC32.85■■■□□ 2.85
PTPRGP23470 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
PTPRGP23470 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC32.85■■■□□ 2.85
PTPRGP23470 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
PTPRGP23470 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
PTPRGP23470 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
PTPRGP23470 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
PTPRGP23470 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
PTPRGP23470 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
PTPRGP23470 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
PTPRGP23470 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
PTPRGP23470 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
PTPRGP23470 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
PTPRGP23470 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
PTPRGP23470 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.84■■■□□ 2.85
PTPRGP23470 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
PTPRGP23470 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
PTPRGP23470 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
PTPRGP23470 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
PTPRGP23470 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
PTPRGP23470 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
PTPRGP23470 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
PTPRGP23470 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
PTPRGP23470 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
PTPRGP23470 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
PTPRGP23470 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
PTPRGP23470 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
PTPRGP23470 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
PTPRGP23470 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
PTPRGP23470 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
PTPRGP23470 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
PTPRGP23470 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms