Protein–RNA interactions for Protein: P21439

ABCB4, Phosphatidylcholine translocator ABCB4, humanhuman

Predictions only

Length 1,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB4P21439 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ABCB4P21439 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ABCB4P21439 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ABCB4P21439 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ABCB4P21439 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ABCB4P21439 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCB4P21439 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCB4P21439 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCB4P21439 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCB4P21439 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCB4P21439 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCB4P21439 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCB4P21439 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCB4P21439 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCB4P21439 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCB4P21439 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCB4P21439 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCB4P21439 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCB4P21439 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCB4P21439 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCB4P21439 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCB4P21439 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCB4P21439 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCB4P21439 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCB4P21439 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCB4P21439 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCB4P21439 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCB4P21439 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCB4P21439 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCB4P21439 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCB4P21439 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCB4P21439 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCB4P21439 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCB4P21439 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCB4P21439 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCB4P21439 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCB4P21439 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCB4P21439 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCB4P21439 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCB4P21439 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCB4P21439 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCB4P21439 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCB4P21439 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCB4P21439 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCB4P21439 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCB4P21439 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCB4P21439 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCB4P21439 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCB4P21439 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCB4P21439 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCB4P21439 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCB4P21439 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCB4P21439 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCB4P21439 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCB4P21439 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCB4P21439 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCB4P21439 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCB4P21439 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCB4P21439 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCB4P21439 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCB4P21439 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCB4P21439 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCB4P21439 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCB4P21439 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCB4P21439 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCB4P21439 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCB4P21439 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCB4P21439 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCB4P21439 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCB4P21439 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCB4P21439 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCB4P21439 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCB4P21439 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCB4P21439 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCB4P21439 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCB4P21439 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCB4P21439 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCB4P21439 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCB4P21439 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCB4P21439 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCB4P21439 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCB4P21439 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCB4P21439 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCB4P21439 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCB4P21439 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCB4P21439 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCB4P21439 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCB4P21439 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCB4P21439 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCB4P21439 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCB4P21439 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCB4P21439 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCB4P21439 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCB4P21439 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCB4P21439 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCB4P21439 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCB4P21439 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCB4P21439 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCB4P21439 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCB4P21439 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms